歡迎關注”生信修煉手冊”! DARNED數據庫收錄了human等多個物種的RNA編輯位點信息,除了最常見的A->I類型的RNA編輯外,還收錄了部...

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歡迎關注”生信修煉手冊”! MISO是一款經典的可變剪切分析工具,和rmats類似,該軟件也支持對可變剪切事件進行定量和差異分析,網址如下 ht...
歡迎關注”生信修煉手冊”! 在某篇評估轉錄組各個分析流程所用軟件的文章中,fusioncatcher 被評為分析融合基因的最佳工具,該軟件的網址...
歡迎關注”生信修煉手冊”! SOAPfuse是華大開發的一款,專門針對human的融合基因進行分析的工具,項目鏈接如下 http://soap....
歡迎關注”生信修煉手冊”! 實驗設計對于轉錄組數據的分析是非常重要的,對于常規的case/control實驗設計,通過兩組間的差異檢驗就可以得到...
歡迎關注”生信修煉手冊”! ENCODE數據庫中包含了許多轉錄因子的chip-seq數據,通過對chip-seq數據進行分析,可以預測得到該轉錄...
歡迎關注”生信修煉手冊”! 在之前的文章中,介紹過igraph工具,可以通過編程處理網絡數據,該工具使用與大規模,大批量數據的處理。如果只是偶爾...
歡迎關注”生信修煉手冊”! 在之前的文章中,我們提到利用網絡聚類算法可以從復雜的蛋白質網絡中挖掘蛋白復合體或者相應的功能模塊,其中MCODE算法...
歡迎關注”生信修煉手冊”! 從數據庫中得到蛋白質的相互作用信息之后,我們可以構建蛋白質間的相互作用網絡,但是這個網絡是非常復雜的,節點和連線的個...
歡迎關注”生信修煉手冊”! 研究蛋白之間的相互作用網絡,有助于挖掘核心的調控基因,目前已經有很多的蛋白質相互作用的數據庫,而string絕對是其...