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  • 大神,咱倆看的應該是一個老師講課的視頻,那個pop文件是怎么搞的?自己做的嗎?

    群體結構——PCA分析

    概念 PCA(principal components analysis)即主成分分析。主成分分析也稱主分量分析,旨在利用降維的思想,把多指標轉化為少數幾個綜合指標。 在統計...

  • 您好,plotQ的quiet=T提示參數不對,請問是怎么回事啊

    基于vcf文件進行Admixture群體結構分析

    ADMIXTURE 是常用的群體遺傳學分析工具,可以估計個體的祖先成分。與 STRUCTURE 相比,它的速度更快。Admixture分析舉例: Admixture中群體的亞...

  • GWAS分析-說人話(14)- 如何查看SNP的基因型

    前言 這年頭,誰還TM的做GWAS~ 今天導師不是想和你看流星雨, 是想和你看看他感興趣SNPs在某個亞組數據中的基因型....... 怎么辦? I have 一堆SNPs,...

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    GWAS分析-說人話(3)網絡數據下載后的處理

    前言 上天會告訴你那個文件才是需要用的嗎? 不會! 但我會!(點個贊,大個賞唄~) 數據下載后,相信我,小白連看哪個數據都會不知道的! 當然,數據分析的第0章,數據下載,也不...

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    CRISPR-Cas9基因編輯技術簡介

    CRISPR-Cas9是繼ZFN、TALENs等基因編輯技術推出后的第三代基因編輯技術,短短幾年內,CRISPR-Cas9技術風靡全球, 成為現有基因編輯和基因修飾里面效率最...

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    RNAseq常規流程

    轉錄組分析是生信分析的一個基礎和常見的分析流程,一般從下機數據開始,經過一系列的質控,基因組比對,差異分析等過程得到實驗組與對照組(或者腫瘤中的轉移組和原癌組)中差異表達的基...

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    生信分析學習筆記 - RNAseq (四) trimmomatic

    聲明:本文部分內容和部分圖片來源于網絡。本文為生信小白學習筆記,不能保證專業名詞和內容全部正確或權威。 下圖為某一條RNAseq從數據預處理,序列回帖到數據可視化的工作流程,...

  • 您好,我是一名研一的生物學研究生,有讀博的打算,目前在自學Linux和python,也學習了一些轉錄組分析軟件和知識,想轉去生物信息學方向讀博,請問一下聯系導師的時候難度大嗎?研究生期間需要怎么準備呢?謝謝

    使用TransDecoder尋找轉錄本中的編碼區

    TransDecoder能夠從轉錄本序列中鑒定候選編碼區。這些轉錄本序列可以來自于Trinity的從頭組裝,或者來自于Cufflinks或者StringTie的組裝結果。 軟...

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