寫在前面，其中的一些具體原理包括算法以后或許會詳細添加。
主要參考主源自李霞老師主編《生物信息學理論與醫學實踐》，陳銘《生物信息學》，馮世鵬《實用生物信息學》，冉隆科《生物信息學最佳實踐》，沈百榮《深度猜測徐數據的生物信息學分析及實例》等，還有可獲得開放資源。
序列比對包括序列之間的比較分析和序列組成和特征分析。
0?? 序列比對(sequence alignment)的概念
1?? 序列獲取：
2?? 雙序列比對
3?? 多序列比對
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1 多序列比對(1):簡介
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2 多序列比對方法
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3 常用工具和數據庫
4?? 核酸序列基本信息和特征信息分析
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0 DNA序列基本信息分析（組分分析和序列轉換）
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1 基因開放閱讀框的識別
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2 核酸序列特征分析(2):CpG島預測
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3 啟動子區域和轉錄終止信號預測
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4 內含子/外顯子剪切位點的識別（外顯子組成和可變剪切）
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5 序列motif的查找和可視化工具
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6 密碼子使用模式的分析
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7 限制性內切酶位點分析
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8 重復序列的查找
