sam轉bam
運行samtools view -@ 16 -b XXX.sam >xxx.bam后報錯
[W::sam_read1] parse error at line 1 [main_samview] truncated file
主要原因是在上一步生成sam文件時,日志信息也被寫入sam文件,導致無法轉換
要想避免這個問題,最好把命令寫入shell文本,然后
nohup sh XX.sh 1>xx.log 2>&1 &
將日志信息定向輸出到log文件中。
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要想避免這個問題,最好把命令寫入shell文本,然后
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將日志信息定向輸出到log文件中。