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vxgzh：生命數(shù)據(jù)科學(xué)。回復(fù)關(guān)鍵詞有相應(yīng)的Rproject。最近畢業(yè)季，暫時不運營平臺，抱歉
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WGCNA分析，簡單全面的最新教程本文應(yīng)該是第二全的WGCNA分析教程，參考了最新的文檔。第一全的還在路上，會出現(xiàn)于生信寶典和宏基因組公眾號組織的二代三代轉(zhuǎn)錄組測序分析實戰(zhàn)班上，歡迎點擊鏈接了解更多。 WGC...
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蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)的缺失值填充
缺失值填充在數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域的預(yù)處理過程繞不過去的一個坎，蛋白質(zhì)組學(xué)也不例外，簡單記錄下，可能有些地方有其特殊之處。 分析缺失值來源：完全隨機缺失（MCAR，如質(zhì)譜儀抖動，對數(shù)據(jù)...
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DIA技術(shù)及其軟件工具介紹前言 關(guān)于蛋白質(zhì)組學(xué)，你是不是已經(jīng)聽了太多公司的宣講，介紹了一大堆的技術(shù)名詞，反而越聽越懵懂，腦袋一團亂麻？就和傳話游戲一樣，當我們接收了多手信息以后，得到的信息就越不準確。...
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【1】蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定軟件之X!Tandem1. 簡介 X!Tandem是GPM：The Global Proteome Machine（主要基于Web的開源用戶界面，用于分析和顯示蛋白質(zhì)鑒定數(shù)據(jù)。關(guān)于GPM的更多內(nèi)容...
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蛋白質(zhì)組學(xué)資料
簡單收集一下全網(wǎng)的蛋白組學(xué)的分析 生信技能樹 1. 蛋白質(zhì)組學(xué)第1期-認識基礎(chǔ)概念[https://mp.weixin.qq.com/s/PBPqiX1Ks5EiS2HBG5...
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顏值夠格的風(fēng)險森林圖0.輸入數(shù)據(jù)和R包 在生信星球公眾號聊天框回復(fù)“forest779”即可獲得輸入數(shù)據(jù)。也可以自己根據(jù)表達矩陣與臨床信息生成，如下： 1.多因素cox回歸 建模就一句代碼，出森...
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cox的predict結(jié)果與加權(quán)乘積居然不一樣1.問題起源 predict的參數(shù)type默認值就是“l(fā)p”，代表線性模型，理論上和大量文章里描述的公式應(yīng)該是結(jié)果相同的。比如這個： https://www.ncbi.nlm...
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基因長度并不是end-start需求 tpm、fpkm這樣的數(shù)據(jù)，計算公式里都有“基因有效長度”，有些地方直接叫基因長度。之前計算這些，都是采用最快的方式—找豆豆。今天想要把這部分逐漸加到課程里，我就必須要...
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生信技能樹蛋白組文章匯總
1. 蛋白質(zhì)組學(xué)第1期-認識基礎(chǔ)概念 2. 蛋白質(zhì)組學(xué)第2期-認識蛋白質(zhì)組學(xué)原始數(shù)據(jù) 3. 蛋白質(zhì)組學(xué)第3期-蛋白質(zhì)組學(xué)的三大元素 4. 蛋白質(zhì)組學(xué)第4期-文章搜庫過程復(fù)現(xiàn) ...
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fasta和fastq格式文件的shell小練習(xí)作業(yè)中參考了：http://www.lxweimin.com/p/bc1fe435879c http://www.lxweimin.com/p/d10a85f21889 ht...
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淺淺的學(xué)習(xí)歷程<br>生信新手，打工人，搬運工。<br>像王子文一樣財務(wù)自由，才可實現(xiàn)生育自由<br>像李子柒一樣把一件事情做到極致，才可實現(xiàn)職業(yè)自由
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非腫瘤純生信：冠狀動脈的分子亞型輕松4+分
大家好，今天和大家分享的是19年1月份在J. Cell. Physiol(IF：4.522) 上的一篇文章，"Identification of the molecular ...
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6+非腫瘤純生信，結(jié)合機器學(xué)習(xí)，免疫浸潤以及分子分型，不到兩個月接收，可重復(fù)！影響因子：6.2 從投稿到接收不到2個月 關(guān)于非腫瘤生信，我們也解讀過很多，主要有以下類型 1 單個疾病分析 2 單個疾病結(jié)合免疫浸潤，鐵死亡，自噬等相關(guān)分析 3 兩種相關(guān)疾...
