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該數據庫致力于收集、整理和提供規范化的miRNA命名信息,為學術界提供方便快捷的查詢工具。通過使用這個數據庫,研究者能夠迅速找到所需的miRNA...
好久不見, 最近一直沒更新, 日更幻想破滅了, 不過還是很開心, 建庫成功了 建庫背景: 又逢一年畢業季, 每次引文都要一篇一篇復制粘貼去Pub...
手敲一篇推文,昨天搭了個數據庫,主要用于存放和檢索PubMed中出現過的數據庫~ 地址: https://haoran-chen.shinyap...
其實經常分析TCGA數據庫時會發現,clinical.tsv中基本沒什么可用信息,大部分數據都是缺失的,那么,如何獲取比較全面的臨床數據,有哪些...
在STRING數據庫中提交基因,獲取PPI網絡是比較常規的操作,包括下游使用cytoscape進行美化和hub網絡的提取,但過程還是比較麻煩,本...
在GEO檢索時,總能見到一些奇怪命名的樣本,這或許與測序時的脫敏相關,但這也給后續數據使用時的篩選帶來不便,本期主要介紹一個數據庫,能大大提高樣...
本系列主要定期集中記錄一些實用的生信操作 1. 第一列作為行名,構建數值矩陣 假如我剛讀取了一個表達譜矩陣gene_exp,第一列為基因名,其余...
我個人看法,不一定對哈,首先,GSEA和GSVA不是一回事,不能放在一起說。 GSVA主要是通過感興趣的基因集來劃分樣本,有樣本基因表達譜和一個...