本文應該是第二全的WGCNA分析教程，參考了最新的文檔。第一全的還在路上，會出現于生信寶典和宏基因組公眾號組織的二代三代轉錄組測序分析實戰班上，歡迎點擊鏈接了解更多。 WGC...
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WGCNA分析，簡單全面的最新教程 -
蛋白質組學數據的缺失值填充
缺失值填充在數據分析領域的預處理過程繞不過去的一個坎，蛋白質組學也不例外，簡單記錄下，可能有些地方有其特殊之處。 分析缺失值來源：完全隨機缺失（MCAR，如質譜儀抖動，對數據...
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DIA技術及其軟件工具介紹前言 關于蛋白質組學，你是不是已經聽了太多公司的宣講，介紹了一大堆的技術名詞，反而越聽越懵懂，腦袋一團亂麻？就和傳話游戲一樣，當我們接收了多手信息以后，得到的信息就越不準確。...
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【1】蛋白質組學鑒定軟件之X!Tandem1. 簡介 X!Tandem是GPM：The Global Proteome Machine（主要基于Web的開源用戶界面，用于分析和顯示蛋白質鑒定數據。關于GPM的更多內容...
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顏值夠格的風險森林圖0.輸入數據和R包 在生信星球公眾號聊天框回復“forest779”即可獲得輸入數據。也可以自己根據表達矩陣與臨床信息生成，如下： 1.多因素cox回歸 建模就一句代碼，出森...
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cox的predict結果與加權乘積居然不一樣1.問題起源 predict的參數type默認值就是“lp”，代表線性模型，理論上和大量文章里描述的公式應該是結果相同的。比如這個： https://www.ncbi.nlm...
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基因長度并不是end-start需求 tpm、fpkm這樣的數據，計算公式里都有“基因有效長度”，有些地方直接叫基因長度。之前計算這些，都是采用最快的方式—找豆豆。今天想要把這部分逐漸加到課程里，我就必須要...
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生信技能樹蛋白組文章匯總
1. 蛋白質組學第1期-認識基礎概念 2. 蛋白質組學第2期-認識蛋白質組學原始數據 3. 蛋白質組學第3期-蛋白質組學的三大元素 4. 蛋白質組學第4期-文章搜庫過程復現 ...
