CibersortX網站是常用的工具，但是是網頁上傳數據，現在網頁503打不開，而BayesPrism在PMID: 37717006[https...
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CibersortX的替代者BayesPrism用單細胞數據去卷積得到普通轉錄組細胞類型比例 -
TIDE 預測樣本的免疫治療反應0.背景知識 TIDE評分越高越容易發生免疫逃逸，免疫治療獲益的可能性就越低，評分>0視為無響應，<0視為有反應。 只有網頁工具和python版...
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BayesPrism|反卷積R包的使用方法官方網站：BayesPrism Gateway[https://www.bayesprism.org/pages/tutorial_deconv...
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腫瘤免疫逃逸作者，Evil Genius 前面介紹了我們機體的免疫系統，但是還是無法阻擋腫瘤發生的命運，而免疫逃逸的問題，無論是單細胞空間、還是外顯子宏基因...
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基于基因表達數據通過mMCP-counter估計小鼠樣本組織浸潤免疫和基質細胞組成引言 在生物信息學分析中，相信目前估計樣本免疫細胞浸潤是必不可少的。目前，在R中有多種方法可以實現上述目的，例如ESTIMATE、CIBERSO...
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思路清奇SCI：24.CTR-DB+免疫在刷Researcher時看到一篇挺有意思的文章，拿來借鑒學習下。 這是神刊Frontiers in Immunology（2022.08.15...
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【R>>IMvigor210CoreBiologies】免疫反應2018年的Nature 上公開了一份尿路上皮癌（BLCA）的免疫治療隊列數據，而這份數據就儲存在IMvigor210CoreBiologies...
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CIBERSORT計算免疫浸潤程度讀CIBERSORT免疫浸潤的代碼實現[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU4NjU4ODQ2MQ==&mi...
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免疫亞型的鑒定與可視化1.背景知識 這是一篇2018年的22分文章，《The Immune Landscape of Cancer》將腫瘤樣本劃分為六種免疫亞型:wo...
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TCR-seq數據分析(一)前言 ??一不小心2020年又過完了，回望這一年的收獲，算了，還是不回望了。作為2020年的最后一貼，今天來跟大家談談如何分析TCR-seq的數...
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