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今天我們介紹可解釋機器學習算法的最后一部分,基于XGBoost算法的SHAP值可視化。關于SHAP值其實我們之前的很多個推文中都介紹到,不論是R...
抽空接著更新之前的數據可視化。本次主要復現之前這篇文獻的圖5中的兩個圖,層級聚類熱圖和柱狀圖。主要用到ggplot2的基礎繪圖功能、pheatm...
今天我們一起學習一篇最近發(fā)表在Journal for immunotherapy of cancer (IF 10.9)上的文章,Machine...
在上次推文中我們介紹了幾種可解釋機器學習算法的常見方法,包括置換特征重要性、偏依賴圖和個體條件期望及其實現。本次我們將繼續(xù)介紹其他的用來解釋機器...
Machine learning is changing the world! 在之前的章節(jié)中(見 連載),我們學習了如何訓練多種不同形式的高級...
之前的推文中多次提到過autoReg這個包,用來實現一鍵單多因素回歸分析,同時可以導出回歸分析的結果為word或ppt格式,只需要簡單修改下格式...
引言 在生物信息學分析中,相信目前估計樣本免疫細胞浸潤是必不可少的。目前,在R中有多種方法可以實現上述目的,例如ESTIMATE、CIBERSO...