RNAseq常規做法是先篩選出差異表達基因，然后針對篩選出來的差異基因做GO富集分析。 1.水稻、小麥GO信息提取 在進行GO富集分析前首先要確定在你所使用的GO富集分析軟件...
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2020-12-17水稻、小麥GO富集分析 -
AgRenSeq一種不依賴參考基因組且能快速克隆R基因的GWAS方法個人總結：GWAS是復雜性狀相關基因定位的常用手段，其結果與參考基因組的選擇有關，若多樣性群體中的候選基因不存在于參考基因組，則無法鑒定。而Kmer-based GWAS則不...
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群體遺傳學與重測序分析分子層面對生物的研究，在個體水平上主要是看單個基因的變化以及全轉錄本的變化（RNA-seq）；在對個體的研究的基礎上，開始了群體水平的研究。如果說常規的遺傳學主要的研究對象是...
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Fst、PI、TajimaD值的計算Fst值的計算 群體間分化指數fst,取值范圍0~1，值越大表明群體間分化程度越高，親緣關系越遠。 這個窗口大小和步長不影響結果 曼哈頓圖 首先上傳數據，每列數據類型都為數值...
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GWAS分析-說人話（20）-單倍體關聯分析前言 來到這里，已經漸漸不是人話了... 估計這輩子我也沒有想到，我把我最厭惡的東西寫出來， 居然是最多人看的...... 分析方法很多，這一小節吐槽官網的這一行代碼，大神請...
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群體結構——PCA分析概念 PCA（principal components analysis）即主成分分析。主成分分析也稱主分量分析，旨在利用降維的思想，把多指標轉化為少數幾個綜合指標。 在統計...
