1.青梅選用表皮光滑，有色澤的，大概500g（一斤）即可。洗凈，裝好。 2.在洗凈的青梅上倒入200g食鹽，進行適當的攪拌。為了更好地除去苦澀的味道，攪拌后需腌制片刻，30分...
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我很懶，但是我很可愛~~
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01LaTeX學習系列之---TeX的介紹與認識
01TeX的介紹與認識 目錄 本系列是有關LaTeX的學習系列，共計19篇，本章節是第1篇。前一篇：無后一篇：02LaTeX學習系列之---TeX環境的搭建總目錄：19LaT...
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測序原理：一代二代三代測序原理詳解1. 一代測序(Sanger sequencing) 雙脫氧鏈終止法采用DNA復制原理。 Sanger測序反應體系中包括目標DNA片段、脫氧三磷酸核苷酸（dNTP）、雙脫氧三...
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火起來的“相分離”是什么？相分離或者說相變（Phase separation，Phase Transition）是目前比較火的一個研究領域，已有的研究表明相分離在細胞中普遍存在，與基因組的組裝、轉錄調...
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【三代】淺談三代測序平臺2011年，美國Pacific Biosciences 公司正式發售第三代測序系統—PacBio RS。這是一臺革命性的DNA測序系統，它融合了新穎的單分子測序技術和高級的分...
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TCGA FPKM 轉化為 TPM
FPKM 一般來說不太好用，轉為TPM進行后續的分析比較合適。下面是FPKM轉化為TPM的R實現： 參考： RNA-Seq的Counts和FPKM數據如何轉換成TPM？[ht...
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RNA-Seq分析|RPKM, FPKM, TPM, 計算對比在高通量測序當中，很重要的一塊就是檢測基因的表達量，它是差異分析和轉錄組數據分析的基礎。與q-PCR相似，基因表達量的衡量也是采取相對定量的方法。落在一個基因區域內的read...
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RPKM, FPKM, TPM
什么是測序深度和測序覆蓋度 測序深度（depth）是指測序得到的總堿基數與待測基因組大小的比值，可以理解為基因組中每個堿基被測序到的平均次數。測序深度 = reads長度 ×...
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轉錄組入門(6)： reads計數要求 實現這個功能的軟件也很多，還是煩請大家先自己搜索幾個教程，入門請統一用htseq-count，對每個樣本都會輸出一個表達量文件。需要用腳本合并所有的樣本為表達矩陣。參考...
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搜索功能基因的假基因
假基因（pseudogene） 假基因也叫偽基因，是基因家族在進化過程中形成的無功能的殘留物。假基因與正常基因序列高度相似，但喪失正常功能，一般情況都不被轉錄，且沒有明確生理...
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Linux基本命令分類
目錄 Linux基本命令 一、文件基本操作命令 1. ls命令 2. pwd命令 3. mkdir命令 4. cd命令 5. touch命令 6. cp命令 7. mv命...
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grep及正則表達式
grep，egrep ，fgrep grep [options] 'PATTERN' [FILES] 選項 -i ，忽略字母大小寫 選項 --color，匹配出的字符串加色顯...
