去重 按symbol列去重，常見標準有3個：最大值/平均值/隨機去重 方法1.隨機去重 方法2.求平均值
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01LaTeX學習系列之---TeX的介紹與認識
01TeX的介紹與認識 目錄 本系列是有關LaTeX的學習系列，共計19篇，本章節是第1篇。前一篇：無后一篇：02LaTeX學習系列之---TeX環境的搭建總目錄：19LaT...
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測序原理：一代二代三代測序原理詳解1. 一代測序(Sanger sequencing) 雙脫氧鏈終止法采用DNA復制原理。 Sanger測序反應體系中包括目標DNA片段、脫氧三磷酸核苷酸（dNTP）、雙脫氧三...
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火起來的“相分離”是什么？相分離或者說相變（Phase separation，Phase Transition）是目前比較火的一個研究領域，已有的研究表明相分離在細胞中普遍存在，與基因組的組裝、轉錄調...
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【三代】淺談三代測序平臺2011年，美國Pacific Biosciences 公司正式發售第三代測序系統—PacBio RS。這是一臺革命性的DNA測序系統，它融合了新穎的單分子測序技術和高級的分...
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TCGA FPKM 轉化為 TPM
FPKM 一般來說不太好用，轉為TPM進行后續的分析比較合適。下面是FPKM轉化為TPM的R實現： 參考： RNA-Seq的Counts和FPKM數據如何轉換成TPM？[ht...
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RNA-Seq分析|RPKM, FPKM, TPM, 計算對比在高通量測序當中，很重要的一塊就是檢測基因的表達量，它是差異分析和轉錄組數據分析的基礎。與q-PCR相似，基因表達量的衡量也是采取相對定量的方法。落在一個基因區域內的read...
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RPKM, FPKM, TPM
什么是測序深度和測序覆蓋度 測序深度（depth）是指測序得到的總堿基數與待測基因組大小的比值，可以理解為基因組中每個堿基被測序到的平均次數。測序深度 = reads長度 ×...
