生物信息學研究。
IP屬地：浙江
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序列比對？你可能需要一個圖形化界面多重序列比對（Multiple-Sequence-Alignment , MSA）應該是序列分析中最為基礎的操作了，筆者之前發(fā)了很大筆墨介紹了MAFFT這款軟件的使用（MAF...
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本地化BLAST+進行目標序列比對舉個栗子??： 最近對擬南芥中的一個叫做CBF的基因非常感興趣，現(xiàn)在我想看看這個CBF基因在一個新測序的物種Am基因組上是否存在，Am中有幾個CBF基因？這樣的查找可以通過本地...
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怎么分析啊？
Bland-Altman Plots(一致性評價)在R中的實現(xiàn)
假設有reader1 和reader2，分別對一定數(shù)量病人的某一影像指標進行評分，現(xiàn)在想看一下這兩位研究者評分的一致性，繪制Bland-Altman圖是一種較為直觀、簡單的方...
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Bland-Altman Plots(一致性評價)在R中的實現(xiàn)假設有reader1 和reader2，分別對一定數(shù)量病人的某一影像指標進行評分，現(xiàn)在想看一下這兩位研究者評分的一致性，繪制Bland-Altman圖是一種較為直觀、簡單的方...
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R可視化——圖形繪制過程中如何實現(xiàn)局部放大？數(shù)據(jù)及基礎圖形的繪制 1、數(shù)據(jù)——以R自帶數(shù)據(jù)集iris為例 2、基于ggplot2包繪制散點圖 局部放大效果的實現(xiàn) 1、加載包——主要基于ggforce包實現(xiàn)圖形的局部放大...
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在R中利用fasta序列構(gòu)建進化樹“進化樹的構(gòu)建怎么操作？”“那肯定是用MEGA啊！” 可是真的好麻煩啊，要先比對再建樹，然后再進行各種美化，習慣了R就用R解決吧。 簡單Google之后發(fā)現(xiàn)R有現(xiàn)成的包可以完...
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不出Rstudio, 實現(xiàn)從多序列比對到畫進化樹本文是對前幾天的打臉打臉之處就在于發(fā)現(xiàn)了muscle的R包，從此不用再為序列比對東奔西跑—— Step 1. 從基因名拿到序列 這一步用到的包：biomaRt ，選擇用sym...
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R語言升級到3.6.0后遇到的Bioconductor安裝問題
前言 目前R 3.6.1 都已經(jīng)preRelease了，我筆記本上的電腦也趕忙把R從3.5.4升級到3.6.0（當然生產(chǎn)力相關環(huán)境還沒敢亂升級，畢竟升級一次R語言還是容易碰到...
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260/280、260/230?含義
A260nm是核酸最高吸收峰的吸收波長，最佳測量值的范圍為0.1至1.0。如果不在此范圍，稀釋或濃縮樣品，使之在此范圍內(nèi)；如果吸光度小于0.05，檢查是否存 在操作因素（如移...
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什么時候可以畢業(yè)?_?
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qRT-PCR實驗及數(shù)據(jù)分析qRT-PCR實驗原理 RT-qPCR由普通PCR技術發(fā)展而來，它是在傳統(tǒng)PCR反應體系中加入熒光化學物質(zhì)（熒光染料或者熒光探針），根據(jù)各自不同的發(fā)光機制實時檢測PCR退火、...
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企業(yè)培訓計劃制定五大要點
企業(yè)培訓計劃制定五大要點 培訓計劃是按照一定的邏輯順序排列的紀錄，它從組織的戰(zhàn)略出發(fā)。在全面、客觀的培訓需求分析基礎上做出的對培訓時間（when），培訓地點（where），培...
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代碼解釋：os.environ['TF_CPP_MIN_LOG_LEVEL'] = '2'
（1）log信息共有四個等級，按重要性遞增為：INFO（通知）<WARNING（警告）<ERROR（錯誤）<FATAL（致命的）;（2）值的含義：不同值設置的是基礎log信息...
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tf.data.Dataset.from_tensor_slices的用法語義解釋：from_tensor_slices，從張量的切片讀取數(shù)據(jù)。 工作原理：將輸入的張量的第一個維度看做樣本的個數(shù)，沿其第一個維度將tensor切片，得到的每個切片是一...
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《一日學習法》——半年內(nèi)，從班級倒數(shù)第一，上升到全年級第一的學習方法（二）
本書的第二章5個秘訣主要是與如何備考相關，如果有需要可以去看原著。 在這一章中作者提到了兩點，是對上一章關于記憶和睡眠的補充。 1.“深入的看4小時不如一小時看一遍，看4遍”...
