發簡信
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【置頂】BioAider V1.527 新版來襲新版本更加穩定，顏值更高，推薦大家使用。 新版特性概要如下： 一、添加新功能 1. 提供基于核苷酸序列K-mer特征的層次聚類分析工具。 2. ...
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BioAider V1.423新版來襲 + 基因突變棒棒糖圖轉眼又臨近畢業季，離別是總會到來的，但也可以選擇留下點什么，如題。 考慮到大家都非常忙，有的甚至還在熬夜寫基金，為此我也長話短說。 對于做序列分...
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RaxML使用手冊
標簽：生信分析，系統發育，進化樹 RaxML是最大似然法（ML法）建樹的經典軟件，可以建有根樹，支持服務器上多線程運行。而且RaxML是目前為數...
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RDP使用手冊
標簽：生信分析，系統發育 背景：RDP是一款檢測重組或重配的軟件，適用于Windows 95/98/NT/XP/VISTA系統的軟件（其實w...
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查找核苷酸或氨基酸序列中的重復基序（重復片段）很多時候，我們需要尋找或者篩選某條序列中存在的重復片段，同時我們事先也不知道有哪些重復片段，以及它們的長度。 相比與其他軟件，我更喜歡BioAi...
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如何簡單上手序列突變分析？無論是小尺度（少量）的序列集，還是大尺度（大量）的序列集，無論是基因片段的突變分析，還是全基因組的突變分析。 又或者，序列為非編碼基因，或非編碼...
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序列比對？你可能需要一個圖形化界面多重序列比對（Multiple-Sequence-Alignment , MSA）應該是序列分析中最為基礎的操作了，筆者之前發了很大筆墨介紹了M...
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使用BioAider快速生成核苷酸+氨基酸序列同一性矩陣在進行序列分析時，難免要做一張序列兩兩比較的同一性（大致和相似性差不多）表，比如下面這樣的： 單一核苷酸或者氨基酸序列同一性表比較好辦，可以通過...
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Jane -- 共進化/跨宿主傳播分析
以病毒為例，病毒經常發生跨宿主傳播，主要發生在近緣物種之間 。許多人類病毒流行病是由動物跨宿主傳播而來，如SARS、MERS、高致病性禽流...