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回歸分析中，如何回歸掉（regress out）一個變量對另一個變量的影響在大尺度微生物生物地理學分析中，經常遇到環境因子和地理距離能一定的相關性，經過VPA分析發現二者有重疊的解釋部分。那么，如何完全排除掉環境因子的...
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singlem,一款可以使用marker基因進行宏基因組reads分類的軟件
最近偶然從一篇PNAs的文章，看到作者不僅進行了16S rRNA測序，而且通過marker基因和宏基因組bins同時計算了群落結構，對比三者發現...
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如何在linux下安裝R包
之前一直在linux下用perl和python居多，對R的使用還停留在windows的Rstudio以及各種linux QIIME2等虛擬環境里...
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使用table2itol生成itol美化文件首先下載安裝table2itol，可以在itol官網help的頁面中搜索table2itol跳轉至github下載。 github上有詳細的下載...
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如何在blast結果中添加詳細的物種信息
之前無論是做blastn或者是blastp都是僅僅在blast結果中顯示了種屬信息，沒有添加詳細的信息，添加種屬信息很簡單，只要結果里生成XML...
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避免和conda環境變量沖突---linux下環境變量的設置方法
最近用conda創建了一個新的環境，conda activate進入新環境后，查看perl和python時還是發現： /usr/bin/perl...
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在linux vim編輯器中編寫python腳本
原來生信處理一直用perl，之前雖然也寫過python，但是linux下縮進4個空格實在有點煩 最近又想重新拾取python，就編輯了一下vim...
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如何便捷的安裝perl模塊
雖然perl面向對象能力偏弱，且perl6一直為人詬病，但是仍然有許多生物信息方面的軟件還是需要用到perl的 這就帶來了一個問題，有時候就會報...
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利用好conda構建環境，處理不同版本軟件的沖突
一臺服務器，如果安裝的軟件多了，難免會各種沖突，好在docker和conda都可以解決這個問題 docker運行麻煩一點，還是優先從conda入...