發簡信
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NGS數據下載
本來想重復冷泉港Lippman 2017年在Cell上的一篇文章：Bypassing Negative Epistasis on Yield i...
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3. SNP Calling以GATK流程為例，簡單來說，SNP Calling主要包括以下幾步： 1. 給參考基因組建立索引：samtools faidx、bwa ind...
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如何成為有效學習的高手
最近在得到聽了這篇文章，感覺比較有用，會隨聽隨更新。 Day 1：高效學習的定義。 高效學習，即找到最適合自己的學習手法，在相對短的時間內集中注...
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2. BSA的原理BSA（Bulked Segregant Analysis），集群分離分析或分離群體分組分析法。兩個特點：1. 混池2. 性狀分離所以，BSA可...
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1. 熱身（案例及實驗設計）什么是BSA-seq BSA（Bulked Sergeant Analysis），即分離體分組混合分析法，也稱為集群分離分析法或混合分組分析法，...
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bash下的特殊變量及含義
特殊變量列表 $0：當前腳本的文件名$n：傳遞給腳本或函數的參數。n 是一個數字，表示第幾個參數。例如，第一個參數是$1，第二個參數是$2。$#...
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Let's awk!
awk是Linux自帶的一種文本處理工具，能夠快速有效地對Linux下的文本文件進行處理，尤其針對較大的文本文件。在處理生信文本文件時，相較于P...
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Lecture 11-20
本地blast使用 下載及安裝： 使用：blast與大多數序列比對軟件一樣，需要對參考序列創建一個哈希結構的數據庫： 序列比對 blast可以對...
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Lecture 1-10最近這周幫助組內成員完成一些高重復性基本濕實驗、下地收集果實，以及自己的一小部分分子生物學實驗外，花了些時間進行了Biostar Handboo...