我們今天就搞清楚這兩個問題：1.什么是無尺度分布2.手工計算軟閾值 無尺度分布 假如我問大家，如果你想認識世界上的任何一個人，需要通過幾個人來聯系？ 6個。 這個就是6度分隔...
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WGCNA 挑選軟閾值 -
WGCNA分析，簡單全面的最新教程本文應該是第二全的WGCNA分析教程，參考了最新的文檔。第一全的還在路上，會出現于生信寶典和宏基因組公眾號組織的二代三代轉錄組測序分析實戰班上，歡迎點擊鏈接了解更多。 WGC...
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單基因TCGA的Cox森林圖怎么畫才好看首先調取Xena網頁的TCGA數據做Cox生存分析，數據可以通過hiplot官網自主研發的ucsc-xena-shiny直接在線獲取訪問https://hiplot.com....
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利用R語言作PPI（免String網頁和安裝cytoscape法）原創來自https://mp.weixin.qq.com/s/xw-x_r9yq6Iiw-4LwyKvWw，本人稍作修改，原文是針對小鼠，現改為人類當得到差異基因后，很多時候...
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GSEA詳細解釋及結果解讀Gene Set Enrichment Analysis (基因集富集分析)用來評估一個預先定義的基因集的基因在與表型相關度排序的基因表中的分布趨勢，從而判斷其對表型的貢獻。...
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小鼠和人的同源基因對應在使用cellphoneDB和italk進行細胞通訊分析時，發現小鼠的結果很少或奇奇怪怪。查了下網上大家的一些解決辦法，發現將小鼠的基因轉成人的同源基因即可做。 這篇文章主要...
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12 STRING蛋白互作數據庫String網址：https://string-db.org/[https://string-db.org/]STRING數據庫是一個研究蛋白質之間相互作用的數據庫，這種作用...
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2 論文圖片排版軟件老師寒假的時候讓我試試看寫文章，然后我就發現，其實文章里面圖片的排版還是比較麻煩的。之前問了一下學長，他也是使用PPT和PS進行的排版。于是我就寫了一個輔助排版的程序，其功能...
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11 KEGG通路繪制有的時候我們會需要繪制一些通路圖用來描述不同基因、蛋白、通路之間的關系。一般來說KEGG數據庫是一個很好的選擇，但是KEGG數據庫中的通路圖是靜態的圖片，而有的時候我們會需要...
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8 注釋數據庫KEGG和GO注釋數據庫KEGG和GO KEGG KEGG數據庫網址[https://www.genome.jp/kegg/] KEGG FTP服務器[ftp://ftp.genome.j...
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1 基因芯片到底是什么
因為之前總是看到基因芯片，但一直不知道這是個什么東西。就花了半個下午時間仔細研究了一下，做了一點筆記。特別不嚴謹的解釋：基因芯片就是把許多不同的探針按照一定的順序固定在固相載...
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