String網址：https://string-db.org/
STRING數據庫是一個研究蛋白質之間相互作用的數據庫，這種作用既包括蛋白質之間直接的物理的相互作用，也包括蛋白質之間間接的功能相關性
除了實驗數據外，STRING還包括了利用其它生物信息學方法預測得到的結果。該系統利用一個打分機制給予這些信息一個權重，并給出一個綜合的打分。
STRING數據庫
點擊SEARCH后會跳轉到一個檢索界面
檢索界面
在這個界面，我們可以使用蛋白的名稱或序列對我們需要的蛋白質進行檢索，也可以對多個蛋白或序列進行檢索（見上圖左側邊欄）。下方的Organism文本框支持自動補全，如鍵入
homo s就會自動識別為Homo sapiens。點擊SEARCH就可以開始檢索了。
STRING檢索結果
以TP53為例，第一個候選項即為我們要找的蛋白。點擊CONTINUE就可以顯示該蛋白的互作信息。
互作信息
如圖，STRING已經顯示了TP53與其他蛋白之間的互作關系。點擊圖像中的節點可以顯示基因的詳細信息。
基因信息
下方的按鈕提供了一些設置、分析的功能以及信息的說明。
- Viewers：更改圖形的樣式
- Legend：提供節點、邊、蛋白質及其得分等信息
- Settings：對于圖形的設置，可以調整邊的含義，按得分篩選節點，定制圖形的樣式、修改圖片格式等。修改完成后點擊UPDATE更新。
- Analysis：這部分包含兩塊內容，一塊是網絡的統計數據，包括邊和節點的數量等，另一塊是對于網絡的各種富集分析的結果，這些結果均可下載（在頁面的最底部）。
- Export：以特定格式導出網絡，包括圖像、表格、XML等，既可以生成可直接使用的結果，也可以導入其他軟件（如Cytoscape）進行處理。
- Cluster：對網絡中的所有節點進行聚類，支持K-Means和MCL兩種聚類方式。
