我們今天就搞清楚這兩個(gè)問(wèn)題：1.什么是無(wú)尺度分布2.手工計(jì)算軟閾值 無(wú)尺度分布 假如我問(wèn)大家，如果你想認(rèn)識(shí)世界上的任何一個(gè)人，需要通過(guò)幾個(gè)人來(lái)聯(lián)系？ 6個(gè)。 這個(gè)就是6度分隔...
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WGCNA 挑選軟閾值 -
WGCNA分析，簡(jiǎn)單全面的最新教程本文應(yīng)該是第二全的WGCNA分析教程，參考了最新的文檔。第一全的還在路上，會(huì)出現(xiàn)于生信寶典和宏基因組公眾號(hào)組織的二代三代轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析實(shí)戰(zhàn)班上，歡迎點(diǎn)擊鏈接了解更多。 WGC...
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單基因TCGA的Cox森林圖怎么畫(huà)才好看首先調(diào)取Xena網(wǎng)頁(yè)的TCGA數(shù)據(jù)做Cox生存分析，數(shù)據(jù)可以通過(guò)hiplot官網(wǎng)自主研發(fā)的ucsc-xena-shiny直接在線獲取訪問(wèn)https://hiplot.com....
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利用R語(yǔ)言作PPI（免String網(wǎng)頁(yè)和安裝cytoscape法）原創(chuàng)來(lái)自https://mp.weixin.qq.com/s/xw-x_r9yq6Iiw-4LwyKvWw，本人稍作修改，原文是針對(duì)小鼠，現(xiàn)改為人類當(dāng)?shù)玫讲町惢蚝螅芏鄷r(shí)候...
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GSEA詳細(xì)解釋及結(jié)果解讀Gene Set Enrichment Analysis (基因集富集分析)用來(lái)評(píng)估一個(gè)預(yù)先定義的基因集的基因在與表型相關(guān)度排序的基因表中的分布趨勢(shì)，從而判斷其對(duì)表型的貢獻(xiàn)。...
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桑基圖R包networkD3 示例[https://mp.weixin.qq.com/s/r7535rbVT5zaoy9eUErs0Q] nodeID必須從0開(kāi)始 R包ggplot...
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小鼠和人的同源基因?qū)?yīng)在使用cellphoneDB和italk進(jìn)行細(xì)胞通訊分析時(shí)，發(fā)現(xiàn)小鼠的結(jié)果很少或奇奇怪怪。查了下網(wǎng)上大家的一些解決辦法，發(fā)現(xiàn)將小鼠的基因轉(zhuǎn)成人的同源基因即可做。 這篇文章主要...
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那些常用的limma操作劉小澤寫于19.12.29 + 2020.1.1這一篇不扯別的，只列我認(rèn)為比較重點(diǎn)的limma包的知識(shí)，所以代碼部分可能比較多。但也會(huì)用不同的知識(shí)點(diǎn)來(lái)區(qū)分 前言 limma的...
