
當一個 NGS 項目中對同一個樣本進行了 WGS 和 RNA-seq 測序,或者對同一個腫瘤患者的腫瘤組織和癌旁組織同時進行 WGS / WES...
tags: linux centos latex texlive 下載安裝鏡像 - Texlive2017 Texlive 是 Tex 的一種比...
為了解決自動化報告之類的問題,測試了幾種不同的方案之后,我選了 LaTex。利用 LaTex 生成 PDF 文檔可定制性強,排版精美,雖然不像 ...
tags: gatk bug 問題發現 我用 GATK 模塊 CombineVariants 合并了 12 個樣本的 VCF 文件,之后發現部分...
tags: NGS duplication 不管從哪個角度看我們都希望測序儀產出的數據中 duplicate 率盡量低。怎樣降低 duplica...
tags: RNA-seq GATK STAR SNP INDEL RNA-seq 序列比對 對 RNA-seq 產出的數據進行變異檢測分析,與...
tags: HISAT2 RNA-seq HISAT2 發表的文章中強調了它的速度很快,我就測試了一下這個工具。 HISAT2 建立索引: 然而...
tags: tophat-fusion tophat-fusion 報錯 RNA-seq 數據檢測融合基因,在 tophat-fusion 這一...
tags: fastq clumpify linux pigz axel Ctrl+R 子曰:“工欲善其事,必先利其器。” 多線程超快速壓縮工具...