
前面已經簡單介紹過GWAS的概念,GWAS分析中所用到的文件以及分析流程,我們在GWAS分析結果文件中經常會看到beta值和P值,他們分別代表什么意思?這兩個值又有什么關系呢...
IntAssoplot包可以將GWAS結果和LD, 基因結構圖整合在一起畫出。介紹來自:https://github.com/whweve/IntAssoPlot[https...
@[toc] 0.1 introduction介紹 高通量技術導致數據維度以及樣本數量呈指數增長,使得對數據集進行手動處理顯得不太實際。但是由于收集數據的技術不完善或者數據本...
在初步特征篩選之后,若使用樹模型,特征經過數值化處理后就可以模型進行效果評估,一般會給出一個AUC或KS的模型評估結果。這里假設我們放入的特征數量為N,我期盼的是通過丟棄某些...
一、何為GWAS? GWAS(Genome-wide Association Study)是對多個個體在全基因組范圍的遺傳變異(標記)多態性進行檢測,獲得基因型,進而將基因型...
概覽 Title:From GWAS to Function: Using Functional Genomics to Identify the Mechanisms Un...
今天我們來看一個非常常見和使用的無監督機器學習算法——K-均值聚類(K-means) 首先我們先了解一下這個算法的大致背景: 首先要知道什么是聚類 聚是一個將數據集中在某些方...
首先介紹三種類型的聚類方法: 原型聚類:假設聚類結構能夠通過一組原型求解。通常算法先對原型進行初始化,然后進行迭代求解。不同的原型表示、不同的迭代求解方式,將會產生不同的原型...
如何搜索文獻 篩選文獻 閱讀文獻和做筆記 搜索文章(以谷歌搜索為例) 谷歌搜索的優勢: 可以專注學者和他的研究動態 它的搜索功能很強大 但是搜索的文章不全面 可以考慮使用Pu...
[組學分析系列的教程--Mental分析],前期還是整理一下前期的教程。前期自己分享了精美圖形的繪制。但是,距離現在很久了,不知道有多少童鞋還會使用或回去復習。從今天開始,前...
全基因組關聯分析(GWAS)大家都不陌生,今天我們給大家介紹下各種格式之間轉化在R語言是怎么實現的。首先我們來看下GWAS都有哪些數據格式: 1. HapMap格式,這也是當...