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IP屬地:云南
  • 根據已有序列提純二三代測序數據

    提純二代數據 提純三代數據

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    FG12組裝注釋全過程

    測序: RNA-seq:100Xnanopore:80Xresequence:30X 質控: 使用fastp對RNAseq和Resequence...

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    數據表達定量

    比對軟件:hisat2 比對率至少70% 飽和性曲線:20M reads數據量即可檢測到80%數據量堿基數目:(150+150)X20M(r...

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    antiSMASH數據庫:微生物次生代謝物合成基因組簇查詢和預測

    臨床上使用的大部分抗生素和藥物均來自植物或微生物的天然產物。結合基因組挖掘的經典分離與分析法使得基于基因組的天然產物途徑鑒定和描述更為方便。 a...

  • 2020-05-05使用SignalP對蛋白序列進行信號肽預測

    信號肽簡介信號肽是蛋白質N-末端一段編碼長度為5-30的疏水性氨基酸序列,用于引導新合成蛋白質向通路轉移的短肽鏈。信號肽存在于分泌蛋白、跨膜蛋白...

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    禾谷鐮刀菌轉錄組分析--準備數據

    1、準備數據:測序數據和參考基因組測序數據:NCBI中SRA數據庫,Accession: PRJNA522013 ASPERA,類似下載加速器,...

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    2020-03-17

    合并矩陣: 輸入:每個樣本定量結果,輸出:reads.count矩陣(gene_count.matrix)用于差異分析,標準化后的矩陣(tpm....

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    2018-09-03

    第一天 數據下載https://sra-explorer.info/? 流程:全部選中--add to collection--saved da...

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