發(fā)簡信
IP屬地：湖南
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根據(jù)已有序列提純二三代測序數(shù)據(jù)
提純二代數(shù)據(jù) 提純?nèi)鷶?shù)據(jù)
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FG12組裝注釋全過程測序： RNA-seq：100Xnanopore：80Xresequence：30X 質(zhì)控： 使用fastp對RNAseq和Resequence...
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數(shù)據(jù)表達定量比對軟件：hisat2 比對率至少70% 飽和性曲線：20M reads數(shù)據(jù)量即可檢測到80%數(shù)據(jù)量堿基數(shù)目：（150+150）X20M（r...
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antiSMASH數(shù)據(jù)庫：微生物次生代謝物合成基因組簇查詢和預(yù)測臨床上使用的大部分抗生素和藥物均來自植物或微生物的天然產(chǎn)物。結(jié)合基因組挖掘的經(jīng)典分離與分析法使得基于基因組的天然產(chǎn)物途徑鑒定和描述更為方便。 a...
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2020-05-05使用SignalP對蛋白序列進行信號肽預(yù)測
信號肽簡介信號肽是蛋白質(zhì)N-末端一段編碼長度為5-30的疏水性氨基酸序列，用于引導(dǎo)新合成蛋白質(zhì)向通路轉(zhuǎn)移的短肽鏈。信號肽存在于分泌蛋白、跨膜蛋白...
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禾谷鐮刀菌轉(zhuǎn)錄組分析--準備數(shù)據(jù)1、準備數(shù)據(jù)：測序數(shù)據(jù)和參考基因組測序數(shù)據(jù)：NCBI中SRA數(shù)據(jù)庫，Accession: PRJNA522013 ASPERA，類似下載加速器，...
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2020-03-17合并矩陣： 輸入：每個樣本定量結(jié)果，輸出：reads.count矩陣（gene_count.matrix）用于差異分析，標(biāo)準化后的矩陣(tpm....
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2018-09-03第一天 數(shù)據(jù)下載https://sra-explorer.info/? 流程：全部選中--add to collection--saved da...