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IP屬地:湖南
  • 根據(jù)已有序列提純二三代測序數(shù)據(jù)

    提純二代數(shù)據(jù) 提純?nèi)鷶?shù)據(jù)

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    FG12組裝注釋全過程

    測序: RNA-seq:100Xnanopore:80Xresequence:30X 質(zhì)控: 使用fastp對RNAseq和Resequence...

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    數(shù)據(jù)表達定量

    比對軟件:hisat2 比對率至少70% 飽和性曲線:20M reads數(shù)據(jù)量即可檢測到80%數(shù)據(jù)量堿基數(shù)目:(150+150)X20M(r...

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    antiSMASH數(shù)據(jù)庫:微生物次生代謝物合成基因組簇查詢和預(yù)測

    臨床上使用的大部分抗生素和藥物均來自植物或微生物的天然產(chǎn)物。結(jié)合基因組挖掘的經(jīng)典分離與分析法使得基于基因組的天然產(chǎn)物途徑鑒定和描述更為方便。 a...

  • 2020-05-05使用SignalP對蛋白序列進行信號肽預(yù)測

    信號肽簡介信號肽是蛋白質(zhì)N-末端一段編碼長度為5-30的疏水性氨基酸序列,用于引導(dǎo)新合成蛋白質(zhì)向通路轉(zhuǎn)移的短肽鏈。信號肽存在于分泌蛋白、跨膜蛋白...

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    禾谷鐮刀菌轉(zhuǎn)錄組分析--準備數(shù)據(jù)

    1、準備數(shù)據(jù):測序數(shù)據(jù)和參考基因組測序數(shù)據(jù):NCBI中SRA數(shù)據(jù)庫,Accession: PRJNA522013 ASPERA,類似下載加速器,...

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    2020-03-17

    合并矩陣: 輸入:每個樣本定量結(jié)果,輸出:reads.count矩陣(gene_count.matrix)用于差異分析,標(biāo)準化后的矩陣(tpm....

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    2018-09-03

    第一天 數(shù)據(jù)下載https://sra-explorer.info/? 流程:全部選中--add to collection--saved da...

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