在RNA-seq的分析中，需要對基因或者轉錄本的read counts數進行標準化過程。因為落在一個基因區域內的read counts取決于基因長度和測序深度。當基因長度越長...
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RPKM/FPKM/TPM在RNA-seq分析中的標準化流程 -
從TCGA數據庫下載數據
從TCGA數據庫中下載數據的方法有多種，常用的方法有：1.從TCGA官網直接下載（數據量小的話可行，數據量太大就pass）2.用TCGA官方工具gdc-client下載3.用...
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數據挖掘20210112學習筆記
tidyr 核心函數 一、數據清理 扁變長(gather-spread) 長變扁 二、分割和合并(separate-unite) 分割 合并 三、處理NA 去掉含有NA的行,...
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數據挖掘20210111學習筆記R語言作圖 低級繪圖函數建立在高級繪圖函數基礎上，不能單獨使用 ggplot2語法 1.入門級繪圖模板2.映射-顏色、大小、透明度、形狀3.分面4.幾何對象5.統計變換6.位...
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