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    SNP在染色體上的密度分布圖

    有兩種方法,先看比較簡單的一種: 結果: 第二種方法就比較復雜了,需要準備兩個文件:一個是包含染色體長度的文件chr_length.txt...

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    RRBS數據分析(一)

    1、RRBS簡介 RRBS即reduced representation bisulfite sequencing:第一步:使用MSPI內切酶處...

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    clusterProfiler包做GO分析

    1、加載需要的包 2、導入數據 我這里的數據其實就是一列基因名,是通過其它分析挑選出來的幾百個基因,想要看看這些基因是否能夠富集到某些特殊的通路...

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    ComplexHeatmap畫基因突變熱圖(一)

    數據格式如下: 若某個基因在某個樣本中既有deletion又有mutation則以;分隔 結果如下: 其中oncoPrint()中有些參數可選,...

  • linux下blast(2.7.1+)的使用

    Blast 的運行方式是先用目標序列建數據庫(這種數據庫稱為database,里面的每一條序列稱為subject),然后用待查的序列(稱為...

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    multiSNV的安裝

    https://academic.oup.com/nar/article/43/9/e61/1113203/multiSNV-a-probabi...

  • 將核酸序列翻譯成蛋白質

    代碼如下(perl):

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科研狗,生物信息學
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