發(fā)簡信
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cj的院服務器數(shù)據(jù)下載及平臺搭建激活環(huán)境 conda activate cj 如何看有啥軟件已經(jīng)安裝 conda list aspera下載數(shù)據(jù) 記得聯(lián)網(wǎng)（悄悄地） 查找asc...
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R獲取KEGG/GO中某一通路所有基因1、通過KEGGREST包來探索KEGG數(shù)據(jù)庫的12大代謝通路 通過觀察KEGG官網(wǎng) ：https://www.genome.jp/kegg/p...
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根據(jù)轉錄組和KEGG代謝基因計算通路活性！！！計算方法是以前初師兄根本文獻扒的，后續(xù)把文章doi附上！！！KEGG基因list,利用R可以很快扒下來，我后面再更新，百度一下你就知道 準...
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count轉fpkm和tpm以下列數(shù)據(jù)為例子，需要count矩陣并包含基因長度、（沒有的話從gtf提取，前面我寫過教程） count矩陣讀入 count to TPM co...
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轉錄組服務器配置以大設施anlei01環(huán)境為例 1、配置miniconda軟件 2、設置環(huán)境 建立一個RNA-seq分析環(huán)境，這樣是為了和其他環(huán)境區(qū)分開，以免本...
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越哥服務器上分析流程留存
把sortbam文件全部上傳到越哥服務器上給服務器上安裝了bedgraphtobw,直接用就行了傳文件使用的命令是 1、合并bam 2、bam轉...
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conda裝好軟件后庫文件缺失問題在學校服務器上conda安裝軟件后 提示安裝成功但是bowtie2報錯缺失庫文件 由于我是非root用戶，權限受限在兩位老師@exps和@wan...
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越哥cuttag分析代碼留存
1、trim_galore去接頭及低質(zhì)量reads 使用nohup掛后臺后可以用jobs -l查看 跑完以后在clean文件夾下，會有val_1...
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【傻瓜美圖】cellphonedb氣泡圖從cellphonedb得到以下四個文件，用中間兩個畫圖 畫圖