在學校服務器上conda安裝軟件后
$conda install -y bowtie2
$bowtie2
$libstdc++.so.6: version `CXXABI_1.3.11' not found
提示安裝成功
但是bowtie2報錯缺失庫文件
image.png
由于我是非root用戶,權限受限
在兩位老師@exps和@wandering大佬的指導下解決了這個問題
1、第一步查看服務器上是不是有缺失的這個文件
$strings /usr/lib64/libstdc++.so.6|grep CXXABI
#如下圖主目錄下有
第二步找到自己環境下的lib路徑
其實就是在自己conda環境的lib里
其實報錯的時候就告訴你哪里缺少這個文件了(見圖一畫紅線的地址)
第三步 缺什么補什么 復制過去
$cp /usr/lib64/libstdc++.so.6 /work/home/algroup01/software/mini/envs/RNA/lib
使用bowtie2 --help 正確出使用說明啦
ps感謝@exps和@wandering及小杜老師@小杜的生信筆記