hello,今天我們繼續(xù)來分享分析代碼部分,這一次,我們直接用單細胞Seurat 的分析結果聯(lián)合VDJ進行分析,話不多說,直接開始。 寫出h5ad 開始分析,數(shù)據(jù)大家換成自己...
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1. Seurat對象查看當前的Assay 在進行了SCTransform操作后,矩陣默認會變成SCT矩陣,如果不加設置,后續(xù)的PCA等操作都是基于SCT矩陣。修改Defau...
今天接到一個小姑娘的咨詢,她問我的公眾號有沒有兼職可以提供,她可以做一些簡單的下游分析賺點外快。 我說沒有呀。 科研服務是個苦差事 其實倒是經(jīng)常有一些讀者來求助,想要找我們做...
作者,追風少年i 時間很快,轉眼就周四了,怎能因昨天的苦難而選擇停留。 今天我們來分享一下關于空間轉錄組的軌跡分析問題。 在最開始,空間轉錄組分析還不是那么成熟的時候,對空間...
這一篇我們做一個詳細的總結,周五了,疫情還沒結束,父母也都老了,有時候真的感覺身為兒子實在不孝,常年在外,回家很少,家里有點事父母也不會跟我這個兒子說,小病小災的也舍不得去醫(yī)...
軌跡分析系列: 單細胞之軌跡分析-1:RNA velocity[http://www.lxweimin.com/p/ee0f7a8e6a06] 單細胞之軌跡分析-2:mono...
之前寫過三篇和CNV相關的帖子,如果你做腫瘤單細胞轉錄組,大概率看過: 單細胞分析實錄(11): inferCNV的基本用法[http://www.lxweimin.com/...