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《Cell》前沿綜述：利用地理科學(xué)幫助實(shí)現(xiàn)空間轉(zhuǎn)錄組分析的最大潛能（三）文章題目：Mapping the transcriptome: Realizing the full potential of spatial ...
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《Cell》前沿綜述：利用地理科學(xué)幫助實(shí)現(xiàn)空間轉(zhuǎn)錄組分析的最大潛能（二）文章題目：Mapping the transcriptome: Realizing the full potential of spatial ...
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《Cell》前沿綜述：利用地理科學(xué)幫助實(shí)現(xiàn)空間轉(zhuǎn)錄組分析的最大潛能（一）文章題目：Mapping the transcriptome: Realizing the full potential of spatial ...
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應(yīng)用Cellpose進(jìn)行細(xì)胞核分割
在這個(gè)教程中，我們將展示如何應(yīng)用組織結(jié)構(gòu)的細(xì)胞分割算法Cellpose（包含在squidpy.im.segment)進(jìn)行空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)圖像的細(xì)胞...
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膠質(zhì)母細(xì)胞瘤免疫亞型分析+免疫組化發(fā)8+分SCI今天給大家介紹一篇2022年1月發(fā)表在OncoImmunology（IF:8.110）上的一篇文章。本研究作者對單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和bulk轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)...
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Tangram 空間轉(zhuǎn)錄組教程（二）前文提到Tangram在基于mapping的步驟，有兩種方式: mode = "cluster"：速度快，占用內(nèi)存少，適用于空轉(zhuǎn)和單細(xì)胞數(shù)據(jù)來自...
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Tangram 空間轉(zhuǎn)錄組教程（一）什么是tangram？ tangram是一種映射單細(xì)胞表達(dá)譜數(shù)據(jù)到空間表達(dá)譜的方法，它收集同一解剖區(qū)域或者組織類型的單細(xì)胞數(shù)據(jù)和空間數(shù)據(jù)。通過整...
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Python + sklearn實(shí)現(xiàn)交叉驗(yàn)證
scikit-learn中計(jì)算交叉驗(yàn)證的函數(shù)： cross_val_score：得到K折驗(yàn)證中每一折的得分，K個(gè)得分取平均值就是模型的平均性能 ...
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Brier score分?jǐn)?shù)從臨床預(yù)測模型角度，構(gòu)建模型有三度。區(qū)分度、校準(zhǔn)度和臨床適用度。區(qū)分度我們通常采用的是AUROC或C Index；校準(zhǔn)度評價(jià)采用的是HL（hos...