作者，追風少年i~
hello，又是一周，新的開始，今天的內容簡單，邏輯圖如下
Spatially-resolved transcriptomics profiles in multi-regional sites in patients with
intrahepatic cholangiocarcinoma (ICC)
大家可以看的出來，空間轉錄組運用的是BGI平臺，Stereo-seq，研究的重點就是空間區域的細胞和基因軌跡。其實我們在分析空間轉錄組的時候通常可以識別到明顯的界面，無論是腫瘤還是正常組織，如下圖：
圖片.png
其實也不止一次提到過這種界面分析在空間轉錄組的重要性。
最開始的分析就是空間區域的細胞密度，這個可以參考文章10X空間轉錄組數據分析之空間細胞密度，
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緊接著就是細胞的空間軌跡
細胞空間軌跡示意圖
下圖是分析的示例
圖片.png
當然了，結合細胞的空間分布與顯著性分析，更為直觀
Segmentation of margin areas and distinct features of immune cells and tumor cells
at invasive fronts
區域的差異可以表征功能差異，同時也體現了基因的空間軌跡
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空間軌跡分析真的是尤為重要
空間軌跡分析
邊界部分永遠是重點
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好了，已經分享給大家了，生活很好，有你更好，百度文庫出現了大量抄襲我的文章，對此我深表無奈，我寫的文章，別人掛上去賺錢，抄襲可恥，掛到百度文庫的人更可恥
