聽說，生信軟件有1000多個，如何在Linux系統下安裝軟件呢？不怕，我們有miniconda。那么，miniconda有怎么安裝呢？

1. miniconda的安裝

Step 1. miniconda package的下載

wget + 下載鏈接
其實，能否自己搜到結果很重要！

Step 2. minniconda安裝

因為miniconda package是bash文件，所以應用
bash + package name進行安裝
一直點“Enter” 或輸入“yes”

Step 3. 激活

source ~/.bashrc

2. 國外網址打開很慢，所以，添加channels，加快下載速度。

3. 使用conda安裝軟件

3.1 搜索軟件包

conda search + package name

3.2 安裝軟件

conda install + package name（= version number）

3.3 卸載軟件

conda remove + package name

4. conda的環境

conda info --envs
重點來了：每個項目應用的軟件不同，即使應用同一個軟件，版本號也不一定相同，所以，創立一個特定的環境，以滿足個人需求顯得尤為重要。

• 創建
  例：conda create -n RNA_seq python=3 fastqc trimmomatic -y
• 激活
  例：source activate RNA_seq

• 卸載
  卸載某個軟件
  例：conda remove -n RNA_seq fastqc -y
  全部卸載
  conda remove -n RNA_seq --all
  注：以上例子均來自生信星球。
  今天的思維導圖如下：

  
  
  Day3--魏東升.jpg