不念到大二，很少接觸到PDF文檔。能讀到博士，過手或過眼的有大幾千份。PDF文檔多了，管理起來很麻煩。有些文檔從網上下載的時候，很少能有個正常的名字，從新命名并服從管理也是一件麻煩的事。當然不寫論文，這都能忍。我最開始接觸這類軟件也并不是要使用它們的管理功能，而是較為次要的論文文獻引用插入。
我用的第一個是Endnote，一個非常偉大的收費軟件，伴隨了我幾乎整個碩士階段。能用它從谷歌學術里直接導入引用條目；Alt+2的快捷插入真的很快捷。當我長久不寫論文，只看文獻的時候，還是用手動的辦法去命名，去分組。有一天，我想把谷歌學術里一個關鍵詞的搜索結果全部導出來的時候，用Endnote就比較費時。學習使用R的時間久了，就發現很多類似的事情可以用幾個函數解決。不是說人變懶了，而是說聰明的人類總是能開發一些偷懶的辦法。也嘗試過Zotero，Chrome類型的瀏覽器能夠安裝Zotero的插件，能夠把一整頁的搜索結果導入到軟件里，是不是非常稱心？如果有PDF的鏈接還能把PDF導入進去，是不是很滿意？但是Zotero的管理和插入功能有些欠缺，不及Mendeley【也許是我不會用】。
我認為用Mendeley的人比較牛，但是獨用用不如分享方便更多的人。Mendeley的第一個好處是免費，不像endnote，不過這個在中國不叫事兒。mendeley的word插入快捷鍵組合是Alt+m。你知道endnote里也很快捷，但是要先在endnote里選中，再切到word中Alt+2，這樣你就得先在endnote里搜。mendeley是怎么干的？不用切換，快捷鍵會召喚一個條框，輸入關鍵詞比如作者，自動給出候選，這一方面就節省了不少時間。mendeley能導入endnote，能導入zotero，反過來endnote不行，就這一條就可以放棄endnote。mendeley的期刊模板更新非常及時，endnote有些雜志的要滯后好幾年。
最重要的一部分，文獻管理和學習。endnote能直接導入PDF【最好是英文的】，根據doi等信息識別出題目等。mendeley的識別效率更高，作者、時間和期刊一般都能給出來，年代久遠的容易出錯。開頭提到一個文獻命名的問題，mendeley里有非常好的解決方案，它能自動從新命名，可以自定義格式比如 作者+時間+title或者時間+期刊名+title，是不是很膜拜。不過mendeley的界面是英文的，一般人不知道怎么設置：Tools>Options>File organizer，3個都勾上，自己摸索吧。還有一個功能我個人非常欣賞，就是PDF文檔內的全局搜索，唯有感謝那些想要“偷懶”而又有能力把懶偷到手的人，感謝。世事艱難，愿我們互相幫扶。
---- Wed Jan 16 21:40:55 2019 更新------------------------------
文獻導入的幾個方法
-
doi
step 1
點【add entry manually】，在彈出的對話框中下拉，把doi粘貼到doi框中，并點擊放大鏡搜索。如果文章過新或過舊（庫里沒有）就檢索不到，還有可能是網絡連接問題。
- 從bibtex導入
在谷歌學術、百度學術【點“引用”】或文章官網都能找到文獻導出，選擇bibtex格式【就是txt文本】，或者把條目復制到文本文檔中保存，文件后綴是.bib或.txt都無所謂。然后直接點add那個加號，找到你剛才從網上導出或手動保存的文件，導入即可。
@article{Evans2017An,
title={An ultrahot gas-giant exoplanet with a stratosphere},
author={Evans, Thomas M. and Sing, David K. and Kataria, Tiffany and Goyal, Jayesh and Nikolov, Nikolay and Wakeford, Hannah R. and Deming, Drake and Marley, Mark S. and Amundsen, David S. and Ballester, Gilda E.},
journal={Nature},
volume={548},
number={7665},
pages={58-61},
year={2017},
}
- 從知網導入
知網并不提供bib引文格式導出，需要用zotero的chrome插件先保存到zotero中，再導出bib。 - 從pdf文件導入
把pdf放到watched folder里會自動添加到軟件中，或者像方法2導入.bib文件一樣。 - 手動
點Add下拉箭頭，Add Entry Manually，在No title處替換成文獻題目，save保存。右鍵新建的條目，點第一個Update Details，就會有奇跡發生。
附3個設置圖，用于pdf文件重命名格式設置、文件夾監視和本地bib庫的保存路徑（不設置不會自動給citation key）：
