1.哈醫(yī)數(shù)據(jù)庫①Lnc2Cancer、Lnc2Meth、LncACTdb、MSDD
2.哈醫(yī)數(shù)據(jù)庫②miRSponge、Co-LncRNA、FACER
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8.LncMAP
- LncMAP簡(jiǎn)介
長(zhǎng)鏈非編碼rna介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄網(wǎng)絡(luò)擾動(dòng)的泛癌圖譜
數(shù)據(jù)庫為用戶提供了一個(gè)友好的下載界面，包括the information of lncRNA-TF-gene triplets, the information of drug-lncRNA, the information of survival analysis and the regulation information of TF-gene. 用戶可以根據(jù)需要下載相應(yīng)的數(shù)據(jù)。該研究提供了一個(gè)系統(tǒng)層面的對(duì)lncrna介導(dǎo)的癌癥調(diào)控干擾的剖析，也為研究lncrna在癌癥中的作用提供了一個(gè)有價(jià)值的工具和資源，促進(jìn)了lncrna相關(guān)的生物學(xué)發(fā)現(xiàn)和治療干預(yù)。網(wǎng)站document也詳細(xì)的介紹了網(wǎng)站的用法。
LncMap
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相關(guān)文獻(xiàn)：
簡(jiǎn)書上也有用戶對(duì)lnmap做了簡(jiǎn)單的介紹 http://www.lxweimin.com/p/29fae074359c
其他資料
LncMAP:lncRNA-TF-gene調(diào)控網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫
- 9.LNCat
- LNCat簡(jiǎn)介
LNCat是一個(gè)綜合性的數(shù)據(jù)庫資源，它存儲(chǔ)了目前可用的24個(gè)lncRNA注釋資源的信息，為每個(gè)資源提供lncRNA結(jié)構(gòu)的基因組瀏覽器，并從多個(gè)角度對(duì)這些資源之間的綜合比對(duì)分析結(jié)果進(jìn)行可視化。LNCat支持對(duì)不同lncRNA注釋資源的快速探索、比較和整合，使研究者能夠在感興趣的區(qū)域內(nèi)實(shí)現(xiàn)對(duì)lncRNA的精細(xì)注釋。
lncat提供以下服務(wù)：
* >（1）基因組瀏覽器。LNCat provides the Browser portal to browse從13個(gè)lncrna注釋資源瀏覽lncrna結(jié)構(gòu)，通過基因名、ID或基因組坐標(biāo)搜索lncrna，實(shí)現(xiàn)所有外顯子結(jié)構(gòu)的可視化，從而有助于發(fā)現(xiàn)這些注釋資源中常見（或獨(dú)特）的外顯子結(jié)構(gòu)。
* >（2）可視化。可視化門戶網(wǎng)站從多個(gè)角度展示了不同資源之間的比較分析結(jié)果，包括基因組信息（外顯子數(shù)、基因長(zhǎng)度、基因組覆蓋率、lncRNas分類、基因組距離、保存和重復(fù)元素）、表達(dá)、組織特異性、染色質(zhì)特征和功能。用戶可以檢查和比較這些lncrna注釋。
* >（3）下載。lncat允許用戶在任何注釋級(jí)別（包括基因級(jí)別、轉(zhuǎn)錄級(jí)別和區(qū)域級(jí)別）下載每個(gè)資源的所有l(wèi)ncrna注釋（如果可用）。它還允許用戶靈活選擇感興趣的資源，然后以聯(lián)合或交叉的方式進(jìn)行資源集成。
LNCat
- 相關(guān)文獻(xiàn)
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