1. 轉基因小鼠
- Tg表示轉基因（transgene），細分如下：
- TgH：同源重組，
- TgR：經逆轉錄病毒載體感染的插入，
- TgN： 非同源插入。
轉入的基因放在圓括號中，不用斜體
轉入報告基因或者重組酶系統（例如，GFP，lacZ，cre）時，因表達的組織特異性不同，應該在轉入基因前表示啟動子，比如Tg(Zp3-cre)
1.1 一般轉基因鼠
TdTomato大鼠：（SD-Gt(ROSA26)tm1(CAG-LSL-Tdtomato)/Bcgen）
# SD大鼠-Rosa26位點-【啟動子-LSL-目的基因】-來自百奧賽圖。
ROSA-啟動子-((loxp-membrane TdTomato - polyA- loxp）-（membrane eGFP-polyA))
ROSA-pCA- loxp-mT-pA-loxp - mG-pA
## mTmG小鼠，Cre重組前能夠在膜上發出紅色熒光，而被Cre重組后則在膜上發出綠色熒光
1.2 Cre工具鼠
一般采用原位敲入（KI）技術，將Cre基因組敲入特定啟動子之后。
根據位置不同又分為兩類：
①將Cre基因敲入啟動子的第一個起始密碼子之后；插入起始密碼子之后的Cre蛋白表達量較高，但可能影響后續蛋白表達；
②將Cre基因敲入啟動子后續蛋白的終止子之前；終止子之前插入的Cre蛋白表達量相對較低，但不會影響蛋白正常表達。
- creER： 為cre重組酶與雌激素受體融合而成，可被tamoxifen激活。如曾經的內皮Cre：MGI:3848982：Tg(Cdh5-cre/ER<T2>)1Rha【或寫作 Cdh5(PAC)-CreERT2】
Cdh5: Cadherin 5, type 2 or VE-cadherin (vascular endothelial cadherin) also known as CD144 (Cluster of Differentiation 144), is a type of cadherin. It is encoded by the human gene CDH5.- The tamoxifen-inducible cre/ERT2 sequence was inserted into a
PAC(Phage1 artificial chromosome) containing the VE-cadherin gene to generate the transgene construct.Rha: provided by Ralf H Adams.
- CreER<T2>：CreER的改進版，T2上標。
通過三個點突變改造ER（estrogen receptor,人類雌激素受體），使之不能結合雌激素，只能結合其類似物（Tamoxifen的代謝產物4-OHT），然后進核發揮Cre重組酶活性，進而增強了對cre酶功能的調控。
2. 定點修飾小鼠
- tm（targeted mutation）：利用ES打靶技術構建的小鼠
- em（endonuclease-mediated mutation）：核酸內切酶系統（如CRISPR/Cas9）介導的基因修飾。
修飾方式上標。
被定點修飾的基因：用基因符號表示，需要斜體
tm：ES細胞同源重組技術
原理 利用Cre-Loxp系統對目的基因進行可誘導表達調控，當兩個Loxp位點位于同一染色體上且方向一致時，Cre重組酶會特異性的將兩個Loxp位點間的序列切除。構建Rosa26-(SA /pCAG)-loxp-Stop-loxp（LSL）-cDNA-pA打靶載體，轉入ES細胞，獲得在Rosa26目的位置發生正確同源重組的ES克隆，并將其注射到小鼠囊胚內細胞團，獲得嵌合鼠，通過與野生型小鼠繁殖得到正確同源重組ES細胞來源的Knockin小鼠。Knockin小鼠可與各類表達Cre重組酶的小鼠雜交，獲得組織特異性表達的小鼠模型。
em： Crispr/Cas9技術
原理 根據Rosa26基因序列設計合成sgRNA，構建含同源序列和目的序列的片段，與Cas9核酸酶mRNA共同注射到小鼠受精卵胞質，Cas9 mRNA、sgRNA與基因組靶序列結合并切割雙鏈DNA，以含目的片段的同源序列為模版修復基因組DNA，最終獲得在Rosa26基因intron中定點插入片段的小鼠。
Rosa26
- ROSA26（Gt(ROSA)26Sor）是6號染色體上的一個安全區域，本身是一個反義長鏈非編碼RNA基因，已被證明在大部分組織和細胞中都有表達。
- 外源性的基因定點插入這個位點不會影響其他基因的表達。20 世紀 90 年代末 由Philipe Soriano 及其同事發現(pnas.94.8.3789)。
Gt: gene trap
β-gal: β-galactosidase，經典的報告基因。
β-geo：另一個報告質粒，融合了gal和neo， Genes & Dev. 1991. 5: 1513-1523 。
2.1 基因中插入基因
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基因敲入小鼠需要標出轉入基因，放圓括號中，上標。
En1基因編碼區被Otx2基因取代。圖片發自賽業公號
IRES（Internal ribosome entry site,內部核糖體進入位點）序列
能招募核糖體對mRNA進行翻譯。
將IRES與外源cDNA融合，發現IRES能獨立地起始翻譯。
IRES不僅存在于RNA病毒中，在很多DNA病毒中也頻繁出現，且在哺乳動物、植物以及酵母中均發現了IRES序列存在，但不同的IRES在功能機理上有一定差異。
2.2 基因敲除
類比可知。
2.3 基因修飾：如flox系統
- Flp/FRT系統，約等于Cre／loxP系統在真核細胞內的同源系統。
FRT(Flp recognition target)- 這兩個系統比較明顯的區別是它們發揮作用的最佳溫度不同，Cre重組酶發揮作用的最佳溫度為37℃，而Flp重組酶為30℃。因此，Cre／loxP系統最適宜在動物體內使用。
Appendix：Jax小鼠命名規則
