純生信發(fā)文的新技能,同一份GEO數(shù)據(jù)可以發(fā)兩篇SCI

為什么有些人總是能發(fā)好幾篇純生信SCI?因為人家掌握了方法,例如利用同一份GEO數(shù)據(jù)可以發(fā)兩篇SCI,具體操作如下:

第一篇純生信SCI可以這樣做:

第一步,數(shù)據(jù)下載處理、合并、矯正、差異分析

第二步,進行WGCNA分析

第三步,進行取交集的基因


第四步,進行GO、KEGG富集分析、PPI分析、構建miRNA-mRNA-TF網(wǎng)絡




第五步,進行免疫相關的分析

第二篇純生信SCI可以這樣做:

第一步,數(shù)據(jù)下載處理、合并、矯正、差異分析

第二步,重點關注免疫分析部分,不做其他分析,CIBERSORT這種算法估計審稿人都看膩了,我們使用ssGSEA算法計算免疫評分,并且分為免疫細胞和免疫功能這兩部分

第三步,進行免疫細胞之間的相關性分析、免疫功能之間的相關性分析

第四步,進行正常組與疾病組之間免疫評分的差異分析

第五步,進行顯著表達的基因與免疫細胞、免疫功能的相關性分析,并且篩選與免疫最為相關的基因(重點分析內容)

第六步,選出與免疫最為相關的基因構建模型(重點分析內容)

第七步,GO與KEGG分析估計審稿人都看膩了,我們來做一下DO分析

根據(jù)上面的操作就可以輕松得到了兩篇純生信SCI,只要你掌握了學習方法一樣可以做到,那怕你從來都沒有接觸過純生信。

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