天然水晶在漫長的生長過程中，由于其生長環境的不斷變化，比如地殼運動、地震等因素，會在水晶中形成棉、云霧、冰裂紋、水紋和礦缺這些瑕疵。
1、棉
常常我們會看到有些水晶里面會有白色物質，小片的像棉絮漂浮，大片的像棉花堆積，這些物質就是俗稱的棉，它是水晶瑕疵里十分常見的一種，尤其是比較大的原石和雕刻擺件里面，通常都可以看到。
2、云霧
有些水晶，從外部看，好似有一層薄霧氤氳在水晶表面，擦之不去，這些物質就是水晶中的云霧。適量的云霧不僅會增添水晶的視覺美，還可以體現出一種虛無縹緲的意境，給人一種朦朧夢幻的感覺。
3、冰裂紋
水晶在生長過程中，如果遇到地震或者是地層的擠壓(地球內應力)，那么就會在內部留下一些特殊的“痕跡”，但它不是真正的裂痕。從視覺上看，有點像劃開的裂痕，這就是所謂的冰裂紋，一般呈條狀、帶狀或者片狀。水晶的冰裂紋都是包裹在水晶的晶體內部，所以并不影響其使用和功效。
4、水紋
在一些水晶里面，會有一些細長如絲、淡如流水的水紋，在光線照射下，會看的更加清楚，或縱橫交錯，或沿著一個方向規律分布，這就是水晶中的水紋。不過一般面積都不是很大，而且顏色也是深淺不一，時斷時續。
5、礦缺
受自然環境影響，天然水晶在生長時，表面會形成一些坑洼或裂紋狀的缺陷，也就是所謂的礦缺。不過一般在加工過程中，都會將這部分切除或者打磨光滑，或者是雕刻成雕件的一部分。雖然可以憑肉眼直接看到，但是摸上去沒有絲毫毛躁感，和周邊的水晶部分一樣光滑圓潤。
瑕疵具有判斷水晶真假的作用，天然水晶一般都具有瑕疵。瑕疵也會影響水晶的觀賞和價值，所以一般情況下，瑕疵越多的水晶，其價值也就越低。但是如果水晶瑕疵的排列很有規律，或者呈現某種特殊的形態，那么水晶的價值反而會大幅提升。
加工技師將帶有瑕疵的晶體切割、打磨、巧妙雕刻，很好的將天然瑕疵完美融入到水晶產品中，從而形成了那許許多多晶瑩華麗的水晶精品。
世界上完美的天然水晶幾乎沒有，這些自然形成的瑕疵，造就了天然水晶的缺憾美，孕育了天地自然的精華，已經成為了天然水晶中最獨特的一部分。
鹿城水晶—專注天然水晶三十年
商南縣鹿城水晶文化研發生產中心是商南縣唯一集水晶開采、原料流通、文化研究、產品設計、生產加工、銷售為一體的水晶全產業鏈民營企業。
鹿城水晶文化研發生產中心位于商南縣孵化園區、占地2400平方米，公司擁有國內最先進的水晶加工設備，具有切割、打磨、噴砂、雕刻、激光內雕、打孔打凹等一流工藝。
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