featureCounts是一個用來統計count數的軟件，運行的速度飛快，比之前用的htseq-count快了好多好多。 照例先說一下怎么下載...
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Hisat2+FeatureCounts+DESeq2流程+作圖！ -
一句代碼同時運行多組富集分析傳統的富集分析的步驟是： 計算出差異表達基因列表 運行GO 運行KEGG當然，也可以運行其他富集分析，比如DO，Wikipathways或者Re...
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WGCNA分析 | 你的數據結果真的是準確的嗎？？加權基因共表達網絡分析 (WGCNA, Weighted correlation network analysis)是用來描述不同樣品之間基因關...
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全轉錄組關聯分析（TWAS）全基因組關聯研究（GWAS）已經確定了數千種與許多復雜特征相關的遺傳變異。然而，它們的生物學機制在很大程度上仍然是未知的。最近提出的全轉錄組關聯...
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RNA-seq的counts值，RPM, RPKM, FPKM, TPM 的異同
RNA-seq的counts值，RPM, RPKM, FPKM, TPM 的異同 現在常用的基因定量方法包括：RPM, RPKM, FPKM, ...
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轉錄組--STAR比對（可用于差異分析、可變剪接分析和call_SNP）
1 建索引 2 比對(若用于GATK，可不排序輸出sam文件) 1)常規比對（一次2個吧, 用于差異分析） 2-pass模式（用于RNA數據的G...
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iTAK：在線預測全基因組轉錄因子TF，轉錄調節因子TR與蛋白激酶PK前言 康奈爾大學，FeiLab的一個預測工具。 iTAK 是依賴于數據庫的用于從蛋白質或核苷酸序列中識別植物轉錄因子 (TF)、轉錄調節因子 (...
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WGCNA基礎概念WGCNA基礎概念 加權基因共表達網絡分析 (WGCNA, Weighted correlation networkanalysis)是用來描述...
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WGCNA得到模塊之后如何篩選模塊里面的hub基因
WGCNA得到模塊之后如何篩選模塊里面的hub基因 原創 生信技能樹 我在生信技能樹多次寫教程分享WGCNA的實戰細節，見： 一文看懂WGCNA...
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轉錄組分析（三）--GO及KEGG富集分析及可視化（包括條形圖及氣泡圖）（對差異基因的可視化）
GO分析（上下調基因分開做，可用于BP,CC,MF分開畫圖） GO分析（上下調一起做，強烈推薦，可以看整體結果，并可選取其中的部分畫圖） GO ...
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