blast是生物信息分析中比較常用的軟件. sequenceserver 最近想搭建一個(gè)局部的web界面的blast,搜到了sequencese...
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blast
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用viroblast搭建本地blast網(wǎng)站寫在前面 由于我們實(shí)驗(yàn)室的主要研究對(duì)象是荔枝，而在ncbi上的blast中還沒(méi)收錄荔枝基因組信息，所以使用起來(lái)不是那么方便。那么我們能不能實(shí)現(xiàn)一...
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Viroblast & Sequenceserver
利用云服務(wù)搭建blast服務(wù) 使用Apache2 rewrite 重定向主頁(yè) sequenceserver 界面更為美觀的blast網(wǎng)頁(yè)應(yīng)用 使...
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什么？！聽(tīng)說(shuō)你還在用viroBlast搭建本地Blast網(wǎng)站？快換成美美噠SequenceServer！寫在前面 剛開(kāi)始整數(shù)據(jù)庫(kù)的時(shí)候，用過(guò)viroBlast搭建Blast服務(wù)，詳見(jiàn)用viroblast搭建本地blast網(wǎng)站 - 簡(jiǎn)書 (jians...
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BLAST結(jié)果可視化老板就是上帝 上帝說(shuō)要有光，于是就有了光 導(dǎo)師說(shuō)要有可視化結(jié)果，于是我努力把結(jié)果可視化~ 前情提示 為了知道測(cè)序reads中污染物的來(lái)源，我們之...
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【基因組學(xué)】使用IGV可視化查看基因組重測(cè)序比對(duì)結(jié)果寫在前面IGV能夠?qū)⒒蚪M的變異情況可視化，因此廣泛應(yīng)用于基因組學(xué)的研究中。下面我以windows下的IGV為例，介紹一下IGV在查看基因組變異...
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基因組比對(duì)結(jié)果的可視化IGV（Integrative Genomics Viewer）是一款本地使用的基因組可視化神器，不管你用何種系統(tǒng)基本上都可找到對(duì)應(yīng)的安裝包，方...
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基因組比對(duì)及T2T kmer可視化軟件---RAviz功能介紹老規(guī)矩，先和同學(xué)們介紹一下為什么要做這么一款軟件？基因組比對(duì)paf格式文件： 當(dāng)同學(xué)們需要進(jìn)行基因組層面的序列比較時(shí)，通常要面對(duì)如上所示的比對(duì)結(jié)...
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blastn的用法
方法參考：https://blog.csdn.net/likelet/article/details/7567426http://blog.sc...
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Python爬蟲技術(shù)實(shí)例詳解及數(shù)據(jù)可視化庫(kù)前言 在當(dāng)前數(shù)據(jù)爆發(fā)的時(shí)代，數(shù)據(jù)分析行業(yè)勢(shì)頭強(qiáng)勁，越來(lái)越多的人涉足數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域。面對(duì)大量數(shù)據(jù)，人工獲取信息的成本高、耗時(shí)長(zhǎng)、效率低，那么是否能用...
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