比較基因組分析，首先需要選定要比較的物種，然后下載這些物種的基因組數據。 基因組數據準備 數據準備1.基因結構注釋文件， gff/gtf格式2....
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比較基因組分析-數據準備
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動物線粒體基因組注釋軟件MITOS2安裝與使用
MITOS2可用于注釋后生動物以及真菌等線粒體基因組注釋，主要注釋線粒體18個核心基因（atp6 atp8 atp9 cob cox1 cox2...
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用R語言調整表格列的順序R語言里的數據框，約等于表格。比表格多一個要求就是一列只允許一種數據類型的存在。 需求 將數據框最后一列放到第一列的位置,形如： 方法一.bas...
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二代測序數據組裝二代數據組裝 構建contig：將所有小片段打成K-mer構建de Bruijn圖，然后會根據給定的參數對de Bruijn圖做一些化簡，最后連...
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【非模式種轉錄組】一、上游分析Linux篇
這里是佳奧！經歷了一個學期，做了幾遍轉錄組，感受頗深。 原理沒變，方法沒變，但是思維需要轉變，我們需要時刻保持清醒： 做自己的項目不再是機械的重...
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RNA-SEQ(七)：TBtools做GO富集分析及R中的可視化題目：對DEseq2差異分析得到的差異基因進行GO富集。 目的：旨在對基因和蛋白質功能進行限定和描述的。 內容：1. 下載GO注釋背景文件，準備...
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Heatmap熱圖繪制 | 宇宙最強視頻教程，零基礎從入門到精通~TBtools 的熱圖功能與Circos圖功能類似，屬于我開發繪圖引擎JIGplot時的副產品。但是呢，估摸著 TBtools 可能是目前濕實驗...
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高效完成「區間取交集」界面化插件制作之chatGPT就是最強助攻！前兩日，收到了Qianghua小師弟投稿的新插件以及插件制作講解視頻。感覺很不錯。 關于插件 BEDtools Intersect GUI Si...
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