題目：對(duì)DEseq2差異分析得到的差異基因進(jìn)行GO富集。
目的：旨在對(duì)基因和蛋白質(zhì)功能進(jìn)行限定和描述的。
內(nèi)容：
1. 下載GO注釋背景文件，準(zhǔn)備好需要富集的基因列表。
2. 將數(shù)據(jù)上傳到TBtools中進(jìn)行基因富集。
數(shù)據(jù)：進(jìn)一步篩選得到的差異基因列表。
工具：TBtools。
步驟：
- 打開TBtools軟件，找到GO enrichment。
image.png
2.在1處可以點(diǎn)下方download在線下載go-basis.obo文件，并上傳。2處上傳下載好的GO注釋背景文件。3處粘貼富集需要的基因列表。然后選擇結(jié)果文件的儲(chǔ)存位置，就可以按下start按鈕進(jìn)行富集。
image.png
結(jié)果：
富集得到如下的結(jié)果文件。表格中是D2天上調(diào)基因富集到的結(jié)果，包括分子功能，生物學(xué)過程，細(xì)胞組分三部分。根據(jù)p<0.05進(jìn)行了篩選，得到的是誤差符合要求的通路。
image.png
