說在前面 相信大家在平時做富集分析時都會有這樣的一個需求：如果能知道感興趣的某條通路中各基因的調控關系，那么就能準確識別出hub基因；或者說找到...
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CBNplot：可視化富集通路中基因的調控關系 -
GSE120974多組學分析復現0.數據介紹 這是一篇發表在Cancer Cell 2019 Sep的文章——Single-Cell Transcriptomics in Me...
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跟著Nature學作圖:R語言ggplot2環形堆積柱形圖完整示例論文 A global reptile assessment highlights shared conservation needs of t...
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RNA編輯：相關數據庫和分析軟件REDItools數據庫： 1.DARNED：https://darned.ucc.ie/包含大約42000個人類基因組坐標的信息。 2.RADAR：http:/...
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NCBI公共數據庫下載10x單細胞數據進行上游分析的全流程參考生信技能書一文打通單細胞上游：從軟件部署到上游分析[https://mp.weixin.qq.com/s/pQyUieRVXohY1enqj...
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網絡生物學與人工智能 | Awesome-GNN
2020/7/9，第一次更新，本文將總結筆者的研究方向一"多組學智能醫療"的子方向"網絡生物學與人工智能"的分支——圖神經網絡（Graph Ne...
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從「Read.fq.gz」到「SNP.vcf」？我用 TBtools 點點點就整完了~[準備花3天時間，寫這個推文] 寫在前面 前述提及，重測序數據分析上游常用軟件三兄弟已經聚齊，于是所有用戶可以在 Windows 下進行重測序數...
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iTAK：在線預測全基因組轉錄因子TF，轉錄調節因子TR與蛋白激酶PK前言 康奈爾大學，FeiLab的一個預測工具。 iTAK 是依賴于數據庫的用于從蛋白質或核苷酸序列中識別植物轉錄因子 (TF)、轉錄調節因子 (...
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qiime2R包整合qiime2和R可視化分析16s數據
背景：qiime artifact 是用于存儲qiime2的輸入輸出以及相關的元數據，并提供結果是如何產生的信息，但是qiime2所產生的art...
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單細胞之軌跡分析-5：slingshot軌跡分析系列： 單細胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.lxweimin.com/p/ee0f7a8e6a06] ...
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