參考一[https://dulunar.github.io/2020/10/14/%E6%B5%8B%E5%BA%8F%E6%95%B0%E6%8D%AE%E7%9A%84%...
IP屬地：馬里蘭州
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使用ImageJ(Fiji)進行oil red染色統計1.導入圖片，并將圖片格式改成32-bit（黑白單通道） 2.將標尺部分去除 3.選擇oil red染色陽性部分，根據自己需求略微調整 4.進行統計 count和%Area等...
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@呆子魚 short for module load
RNA-seq：STAR 軟件比對（SLURM遞交系統）
索引構建 構建好索引后，第一次比對 構建二次比對的新索引： PSSTAR緩存文件太大，7TB空間run 190個RNA-seq都吃不消，還是用For循環來做。
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RNA三維結構預測與比較Pymol使用[http://www.lxweimin.com/p/a585f1173a32]Zhang lab[https://zhanggroup.org/] 二級結構預...
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TCGA原始文件id轉換本文適用于下載受保護的數據的文件，從文件id轉換為TCGA樣本id官網教程[https://docs.gdc.cancer.gov/API/Users_Guide/Searc...
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制作fasta文件(標準化)該教材是如何制作固定每行70堿基的fasta文件，主要設計如何將特別長的堿基序列均勻切割成每行70個堿基的文件。代碼如下：如何構建fasta文件及其index索引文件[htt...
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excel堿基互補配對插件
最近發現一個比較好用的堿基互補配對的插件[https://github.com/LJI-Bioinformatics/Excel-Reverse-Complement]在ma...
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Gviz繪制基因isoform結構The Gviz User Guide[http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/Gviz/in...
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R做深度學習之-MLP二分類問題
深度理解多層感知機MLP[https://cleverbobo.github.io/2020/08/30/bp/]隱層節點數選擇[https://www.cxyzjd.com...
