Salmon 是轉錄本定量軟件,使用轉錄本定量主要優點一是更準確,比如不同樣本同一基因使用不同 isoform 此時基因長度并不相等,直接基因定量無法顧及;二是方便進行可變剪...
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estimate包可以通過RNA-seq的數據來計算標本的免疫及機制評分,進而評估腫瘤的純度,其原理通過特征的腫瘤的RNA-seq的signture來評估以上內容,其輸入文件...
所謂:操千曲而后曉聲,觀千劍而后識器。 作為一個開源軟件,R的一個非常大的優點就是我們可以隨意查看所有算法的源代碼,在對這些源代碼進行分析的過程中不僅可以加深對算法的認識,而...
1.讀取基因表達數據 這是我的基因表達量數據 1.1提取部分數據集 1.2提取基因表達值所在的列,組成新的矩陣,并將矩陣轉置 為什么要轉置,參考https://www.jia...
曾經我用 rMATS 進行可變剪切分析,現在我覺得 IsoformSwitchAnalyzeR 更香。 IsoformSwitchAnalyzeR 功能總結如下。 In su...
整理思路:先畫出中間的火山圖,再畫左右兩張放大版的圖,最后用AI將三張圖拼接到一起,鋼筆工具畫出中間連接的小T形,同色的小矩形把連接處的實線蓋住,打造出一種藕斷絲連的神秘感(...
轉自:https://www.medsci.cn/article/show_article.do?id=55c91839569a 要做相關性分析,該如何選擇正確的統計方法? ...