腫瘤免疫細胞浸潤模式是基于TCGA數據庫進行研究的。首先，簡要介紹免疫細胞的記憶模式概念。接著，將通過特定的軟件和原理來預測腫瘤組織中的免疫細胞種類。 為了進行這項研究，需要...
IP屬地：上海
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特朗普看了都說好的腫瘤免疫數據挖掘教程 -
公眾號：誤入BioInfor的大黃鴨
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【r<-方案】TCGA barcode（樣本ID）以及重名過濾我之前在簡書上轉載過別人寫的TCGA barcode介紹，這兩天碰到相關的問題，我看了看，覺得不是很清晰，再說道說道。 接觸和分析過TCGA數據的朋友肯定會經常處理TCGA ...
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各位大佬，請問TCGA中來自同一個病人的多個樣本的問題，在進行生存分析和COX分析時該如何處理呢？
TCGA學習03：生存分析
TCGA學習01：數據下載與整理 - 簡書 [http://www.lxweimin.com/p/79816a20cbb1]TCGA學習02：差異分析 - 簡書 [htt...
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收集一些生物信息學的分析流程的文章。感謝這些簡友整理的生信分析流程！ 如果簡友投稿沒有被我收入專題，可能是我沒看到或者收入到其他針對性更強的專題中了。望見諒！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的，查看的時候請點擊“最新收錄”然后進行查看。 ?? 全基因組測序(WGS)分析 ?? 轉錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質免疫共沉淀技術ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 ?? 單細胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預后標志物查找 ?? 系統發育演化進化樹構建與分析 ?? 群體遺傳學分析 ?? 全基因組關聯分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細節的比如熱圖、曼哈頓圖的繪制等 ?? python、perl、R的包的使用過程 ?? 具體工具的使用，比如GATK的使用過程 ?? 數據庫的挖掘方法，比如TCGA數據庫的使用 ?? 另外就是整個文章走下來的流程 ?? ?? ??
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一行代碼繪制物種組成圖為什么要寫這篇文檔，昨天在教一個朋友做數據可視化發現即使是16s分析中一個簡單的物種組成圖對新手來說也是挺難的，數據的導入，過濾，格式轉換等；這一番操作是實在是繁瑣，曾經有大...
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如何利用NR庫快速進行物種鑒定
引言 在做基因或者蛋白質功能注釋的時候，NR數據庫包含非常重要的信息。但是有沒有人跟我一樣遇到相同的苦惱，就是在運行的時候特別耗時，經過一番搜索后，發現可以根據實際數據建立自...
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15 個讓新手愛不釋手的 Python 高級庫
為什么我喜歡 Python ？ 對于初學者來說，這是一種簡單易學的編程語言；另一個原因：大量開箱即用的第三方庫，正是 23 萬個由用戶提供的軟件包使得 Python 真正強大...
