腫瘤免疫細(xì)胞浸潤模式是基于TCGA數(shù)據(jù)庫進(jìn)行研究的。首先,簡要介紹免疫細(xì)胞的記憶模式概念。接著,將通過特定的軟件和原理來預(yù)測(cè)腫瘤組織中的免疫細(xì)胞種類。 為了進(jìn)行這項(xiàng)研究,需要...
腫瘤免疫細(xì)胞浸潤模式是基于TCGA數(shù)據(jù)庫進(jìn)行研究的。首先,簡要介紹免疫細(xì)胞的記憶模式概念。接著,將通過特定的軟件和原理來預(yù)測(cè)腫瘤組織中的免疫細(xì)胞種類。 為了進(jìn)行這項(xiàng)研究,需要...
我之前在簡書上轉(zhuǎn)載過別人寫的TCGA barcode介紹,這兩天碰到相關(guān)的問題,我看了看,覺得不是很清晰,再說道說道。 接觸和分析過TCGA數(shù)據(jù)的朋友肯定會(huì)經(jīng)常處理TCGA ...
引言 在做基因或者蛋白質(zhì)功能注釋的時(shí)候,NR數(shù)據(jù)庫包含非常重要的信息。但是有沒有人跟我一樣遇到相同的苦惱,就是在運(yùn)行的時(shí)候特別耗時(shí),經(jīng)過一番搜索后,發(fā)現(xiàn)可以根據(jù)實(shí)際數(shù)據(jù)建立自...
為什么要寫這篇文檔,昨天在教一個(gè)朋友做數(shù)據(jù)可視化發(fā)現(xiàn)即使是16s分析中一個(gè)簡單的物種組成圖對(duì)新手來說也是挺難的,數(shù)據(jù)的導(dǎo)入,過濾,格式轉(zhuǎn)換等;這一番操作是實(shí)在是繁瑣,曾經(jīng)有大...
用python代碼導(dǎo)出百度網(wǎng)盤文件目錄 一、用PyCharm 創(chuàng)建項(xiàng)目 新建一個(gè)py文件,baiduexport.py,貼入以下代碼: 二、運(yùn)行 三、選擇db文件目錄 選擇百...
為了更熟練掌握面向?qū)ο螅妹嫦驅(qū)ο缶幊虒懥税俣染W(wǎng)盤的爬蟲,爬蟲部分都已完工,使用python3。自己在本機(jī)跑了快一個(gè)小時(shí),目測(cè)效率還行。如果要部署使用,需要自己補(bǔ)充入庫以及u...
導(dǎo)讀: clustlasso函數(shù)包lasso函數(shù)進(jìn)行建模和預(yù)測(cè),包中clustlasso函數(shù)也可以進(jìn)行相似的建模和預(yù)測(cè)。 clustlasso安裝:https://www.j...
上一節(jié)介紹了組內(nèi)相關(guān)性熱圖的繪制,這一節(jié)來介紹組間相關(guān)性熱圖,即由2組數(shù)據(jù)之間的相關(guān)性,廢話不多說直接看代碼喜歡可以關(guān)注公眾號(hào)R語言數(shù)據(jù)分析指南,先行拜謝了 注:需保證tab...
惡性腫瘤的發(fā)病率和死亡率呈上升趨勢(shì),已成為世界上第二大死因。目前,抗腫瘤藥物是治療癌癥最常用的方法之一。近年來,隨著對(duì)腫瘤生物學(xué)及相關(guān)學(xué)科的深入研究,研究人員逐漸發(fā)現(xiàn)細(xì)胞癌變...