知識背景 廣義線性混合模型可以看做是廣義線性模型（GLM）以及線性混合模型(LMM)的擴展，為了更好地理解GLMM，肯定要對普通線性模型、廣義線性模型以及線性混合模型有個理解...
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廣義線性混合模型（GLMM）
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系統發育基礎知識介紹
系統發育學概念 系統發生（或種系發生、系統發育，phylogeny）是指生物形成或進化的歷史。系統發生學(phylogenetics)研究物種之間的進化關系，其基本思想是比較...
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SAS用數組的方式查找缺失值在SAS中，數組的一般形式為： 其中： array是定義數組的標志； 數組名的命名規則與SAS數據集名一樣； 下標指定數組中包含的元素個數，這里的元素一般就是變量，可以使用“...
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SAS數據的對比和清洗數據的對比 SAS中對比兩個數據集的命令是proc compare，它的基本格式如下： 其中，proc compare語句是調用數據比較過程，選項base和compare分別...
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PH525 series - Discovering Batch Effects with EDA本章節的主要內容是如何使用探索性數據分析（EDA）檢測批次效應，使用的示例數據依舊是基因表達數據。 數據準備 從上圖中我們可以看到，男性女性的區別是很明顯的，所以我們可以通過...
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Microbial trend analysis介紹 2020年1月31日METHODOLOGY上線了一篇文章《Microbial trend analysis for common dynamictrend, group...
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PH525x series - Simpson’s Paradoxbatch effect（批次效應） 在高通量研究中，常常被忽略的一個問題就是批次效應，簡單的說，批次效應就是由實驗條件、試劑批次和實驗人員等等因素的不同，而造成試驗出現誤差...
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PH525x series - Class Prediction本文的題目是class prediction（分類預測），其實就是機器學習，這兩個詞可以互相替代著使用。而本章呢，其實就是對機器學習進行一個簡單的介紹，如果你想深入學習，作者...