發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：上海
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RNA 速率學(xué)習(xí)筆記最近學(xué)習(xí)畫單細(xì)胞的擬時(shí)序軌跡圖，有一些收獲。大家經(jīng)常使用的一般是monocle，DPT等；RNA velocity是一個(gè)比較復(fù)雜的方法，它通過細(xì)...
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scale_color_tableau顏色我們?nèi)粘Ｔ趃gplot繪圖時(shí)，使用的都是 最近新發(fā)現(xiàn)了一個(gè)顏色版；可以通過 ggthemes的命令 scale_color_tableau()獲...
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單細(xì)胞測(cè)序類型記錄
高通量： 10X（3′ or 5′ scRNA-seq methods ） 特點(diǎn)：只有部分基因體覆蓋較低的細(xì)胞覆蓋深度 低通量： SMART-s...
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詞云圖wordcloud2：做出好看的詞云圖展示字符串的利器，畫一個(gè)漂亮的詞云圖 最簡(jiǎn)單的使用 設(shè)定特定的形狀
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韋恩圖UpSetR；比傳統(tǒng)韋恩圖更加清晰最近剛好用到韋恩圖，但是由于term比較多，VennDiagram的可視化效果并不好。然后再一個(gè)帖子里看到了UpSetR和Y叔的改進(jìn)版本upse...
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三陰性乳腺癌（TNBC)
三陰性乳腺癌是乳腺癌的一種亞型，其特征是缺乏雌激素受體（ER：estrogen receptor)、孕激素受體（PR：progesterone ...
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ClusterProfiler用法簡(jiǎn)介
碼住，有時(shí)間寫
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功能注釋富集分析工具總結(jié)最近用來(lái)做功能注釋的方法非常多，走過多個(gè)坑之后，對(duì)功能注釋做一個(gè)總結(jié)。 我們常用的功能注釋也就是GO，KEGG，和Reactom，MSigDB數(shù)...