pip本地安裝錯誤 當本地安裝 出現下面報錯 可能有兩個原因 1，你的平臺不是Linux系統，需要重新下載對應版本的whl文件。 2，可能下載的whl文件名不符合規范 首先查...
IP屬地：陜西
-
# pip本地安裝錯誤
-
**服務器免密登錄**
在日常學習工作中，我們經常需要連接遠程服務器，每一次輸入密碼都很麻煩，或者是服務器本身設置就是必須免密登錄，所以今天我就交大家如何免密登錄，以及如何在xshell和vs co...
-
2、RNAseq(2)--測序原始數據處理（Clean data）1、fastq文件 一般我們從公司里得到的原始測序數據都是屬于fastq.gz文件, .gz是一種壓縮格式的縮寫，于是首先第一步是對這些壓縮格式進行解壓操作 解壓好的文件即正...
-
# sigprofiler的安裝與使用sigprofiler的安裝與使用 SigProfiler提供了一套完整的生物信息學工具來進行突變特征分析。該軟件涵蓋了分析流程，從生成突變矩陣開始，到完成特征提取，以及繪圖...
-
寫代碼時遇到的小問題
有時我們在構建函數后，用的時候會提示里面的一個對象找不到，比如： 但是我們仔細檢查函數，發現這個對象是存在的拆開來運行都不報錯，但一封裝起來就報錯。首先看你的對象是在函數外還...
-
-
看下我下載hicpro2juicebox.sh的目錄
Hic-pro的結果文件轉化為.hic文件，在juicebox中實現可視化
hic數據經過Hic-pro處理后，會生成allvalidpairs文件，這是所有有效配對的文件。一般想要可視化的話，比較復雜。這時我們就可以把它轉化為.hic文件，放到ju...
-
幾種常用的差異分析方法簡介幾種常用的差異分析方法簡介 如今在生物學研究中，差異分析越來越普遍，也有許多做差異分析的方法可供選擇。但是在實際應用中，大多數人不知道該使用哪種方法來處理自己的數據，所以今天...
-
基因 ID 和 Symbol 轉換前言 看了這么多期的 circos，都有點乏了，換換口味也是好的。 下面，咱就開始吧。 做生信分析，總是免不了要給基因 ID 和 Symbol 轉換來轉換去。 方法 一般要進...
-
整理ICGC 表達數據參考：ICGC數據庫數據提取表達矩陣/如何提取癌癥數據--生信自學網使用spread 出現的坑--劉小澤簡書 目的：當我們使用TCGA 表達數據，數據以gene-sample...
-
@c50ed7bb4362 直接搜鏈接轉化，第一個就是
使用wget下載GEO數據
我們有時需要下載GEO數據，使用getGEO的話比較麻煩，特別是當我們只需要其中某一兩個文件時。但是當我們直接復制文件鏈接，使用wget下載時，卻只能下載當前的網頁。 經過我...
-
各種HIC處理數據之間的相互轉化
各種HIC處理數據之間的相互轉化 目前HI-C數據研究比較火爆，出現了各種各樣的工具來分析HI-C。這些工具各有優缺點，而且對應的有不同的下游處理工具。但這些工具的結果數據格...
-
driver mutation 識別方法（部分簡介）Driver mutation 識別方法（部分）簡介 背景 眾所周知，癌癥的發生主要是由于突變的累計引起的，但是癌癥細胞中有著成千上萬的突變，并不是所有突變都對腫瘤的演化具有...
-
Hic-pro的結果文件轉化為.hic文件，在juicebox中實現可視化hic數據經過Hic-pro處理后，會生成allvalidpairs文件，這是所有有效配對的文件。一般想要可視化的話，比較復雜。這時我們就可以把它轉化為.hic文件，放到ju...
-
使用wget下載GEO數據我們有時需要下載GEO數據，使用getGEO的話比較麻煩，特別是當我們只需要其中某一兩個文件時。但是當我們直接復制文件鏈接，使用wget下載時，卻只能下載當前的網頁。 經過我...
-
Hic-pro 的安裝
目前處理Hi-c數據的工具主要是Hic-pro和juicer。juicer相對來說更好用一些，因為更加流程化一些。(具體使用方法見《HIC數據介紹及相關分析》）但鑒于Hic-...
