生物信息學專業<br>公眾號：生信學習手冊
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samtools使用大全
samtools是一個用于操作sam和bam文件（通常是短序列比對工具如bwa,bowtie2,hisat2,tophat2等等產生的，具體格式可以在消息框輸入“SAM”查看...
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生信小白教程之Count轉TPM，FPKM相信很多科研工作者（不包括比我厲害的大佬們）在做轉錄組時，都是在公司做測序，然后數據也交給公司分析，又然后，期待做個差異分析，得出像下圖那么完美的熱圖。 然而，然而，，我們得...
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理解SAM文件格式以及過濾sam文件RNA-seq或者ChIP-seq等等測序的上游分析流程里的比對步驟相信大家都知道，我之前也只是按照各種教程去走流程，并沒有仔細的研究過每一步的內容。今天這篇文章學習一下sa...
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學習小組Day7筆記-zkh測序 Sanger測序 ddNTP測序讀長長（1000bp），準確通量低 二代測序 PE（Pair End雙端） 邊合成變測序（sequence by synthesis, ...
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學習小組Day6筆記-zkh配置鏡像源 options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/[https://mirr...
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學習小組Day5筆記-zkhR-數據結構 表格在R語言中叫數據框 函數或者命令不會用時，除了百度/谷歌搜索以外，用這個命令查看幫助：?read.table，調出對應的幫助文檔，翻到example部分研究...
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學習小組Day4筆記-zkh安裝Rstudio電腦用戶名必須是英文（Desktop的上一級就是用戶名） 下載R和Rstudio Rstudio清華鏡像：Tools——Global options——pa...
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學習小組Day3筆記--zkh
如何在linux環境下安裝軟件——conda conda就是linux的應用商店，日常生信使用小而精的Miniconda即可 安裝和使用Miniconda 安裝 百度/谷歌搜...
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學習小組Day2筆記-zkh一、什么是linux，什么是服務器？ 1. linux是什么？ Linux是個操作系統（OS），類似windows和Mac （1）應用場景 應用于supercomputer（...
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