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確定閾值分為了不同的流派。 第一種方法，Bonferroni矯正 這種方法應用最多，一般是N表示參與分析的SNP的個數，閾值可以是： * 1/N...
1. 代謝組數據示例（test_meta.txt） SampleID mws1401 A13 0.00 A16 0.00 A7 0.00 A17...
gatk --java-options "-Xmx185g -Djava.io.tmpdir=./tmp" HaplotypeCaller -R...
建立一個.inputrc文件夾 # /etc/inputrc - global inputrc for libreadline # See re...
1. 原因：利用gmaps回帖基因，會損失和錯誤很多，導致busco結果降低。所以可以直接基于掛載生成的agp文件直接進行轉化，不損失任何基因。...
Mark一個很經典的三維基因組學學習筆記 參考：https://geekdaxue.co/read/davey-brweo@xfltrm/ncf5i6
1. Hic數據mapping（Align Hi-C data to the assembly, remove PCR duplicates a...
plink --vcf All.input.vcf --biallelic-only --recode vcf-iid --out input....
問題1.因為WGBS測序的原理是亞硫酸鹽處理會使未甲基化的胞嘧啶（C）被轉化為脫氨基胞嘧啶（T），而甲基化的胞嘧啶（5-methylcytosi...